RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 TTC8Q8TAM2 541 aa17.17■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 PGBD4Q96DM1 585 aa17.17■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 ICAM1P05362 532 aa17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 HMGCS2P54868 508 aa17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC12A3P55017 1021 aa17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP17.16■□□□□ 0.347e-7■■□□□ 14.4
CTDSP2-201ENST00000398073 C4orf22Q6V702 233 aa17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM71DQ8N9W8 422 aa17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 GLIS3Q8NEA6 775 aa17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 SPATA33Q96N06 139 aa17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 HSD3B7Q9H2F3 369 aa17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 HEY2Q9UBP5 337 aa17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 AGAP1Q9UPQ3 857 aa17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 MAPTP10636 758 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 NPTX2P47972 431 aa17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 MAPRE2Q15555 327 aa17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 TFDP3Q5H9I0 405 aa17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 LRP10Q7Z4F1 713 aa17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 SEPT1Q8WYJ6 367 aa17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 DNAJC19Q96DA6 116 aa17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 CMTM5Q96DZ9 223 aa17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 TRIM49D1C9J1S8 452 aa17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 C3P01024 1663 aa17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 MCF2P10911 925 aa17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 RBP5P82980 135 aa17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 SPDYE2Q495Y8 402 aa17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 KCNV1Q6PIU1 500 aa17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 CENPTQ96BT3 561 aa17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 GPRASP2Q96D09 838 aa17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 DCLRE1BQ9H816 532 aa17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 FBXO28Q9NVF7 368 aa17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 PYGMP11217 842 aa17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 BRD2P25440 801 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 ADORA2BP29275 332 aa17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 SHMT1P34896 483 aa17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 OVGP1Q12889 678 aa17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 DPY19L2Q6NUT2 758 aa17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa17.16■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 MON2Q7Z3U7 1717 aa17.15■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa17.15■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 Q3C1V9 767 aa17.15■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 C2CD6Q53TS8 623 aa17.15■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 TATDN2Q93075 761 aa17.15■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM111AQ96PZ2 611 aa17.15■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 GANQ9H2C0 597 aa17.15■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 GSTA4O15217 222 aa17.15■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 POU5F1BQ06416 359 aa17.15■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 CNGA3Q16281 694 aa17.15■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 SV2AQ7L0J3 742 aa17.15■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 EXT2Q93063 718 aa17.15■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa17.15■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 RARAP10276 462 aa17.15■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 TBCCQ15814 346 aa17.15■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 POTEAQ6S8J7 498 aa17.15■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 LRRC43Q8N309 656 aa17.15■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 ACER1Q8TDN7 264 aa17.15■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 ANKRD27Q96NW4 1050 aa17.15■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 TAAR1Q96RJ0 339 aa17.15■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC12A1Q13621 1099 aa17.15■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 AGR3Q8TD06 166 aa17.15■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP17.15■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 PIM2Q9P1W9 311 aa17.15■□□□□ 0.34
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM86B1E9PN63 330 aa17.14■□□□□ 0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM86B2P0C5J1 330 aa17.14■□□□□ 0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa17.14■□□□□ 0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 SLIT3O75094 1523 aa17.14■□□□□ 0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 FRMPD4Q14CM0 1322 aa17.14■□□□□ 0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 FGRP09769 529 aa17.14■□□□□ 0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 GPD1P21695 349 aa17.14■□□□□ 0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 RGS7P49802 495 aa17.14■□□□□ 0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 RCN1Q15293 331 aa17.14■□□□□ 0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 CHI3L2Q15782 390 aa17.14■□□□□ 0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 C4orf32Q8N8J7 132 aa17.14■□□□□ 0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa17.14■□□□□ 0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 CLMNQ96JQ2 1002 aa17.14■□□□□ 0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 L3MBTL1Q9Y468 752 aa17.14■□□□□ 0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 IL18RAPO95256 599 aa17.14■□□□□ 0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 IL1RL1Q01638 556 aa17.14■□□□□ 0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 SATB1Q01826 763 aa17.14■□□□□ 0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 TRIP10Q15642 601 aa17.14■□□□□ 0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 LRRC36Q1X8D7 754 aa17.14■□□□□ 0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
CTDSP2-201ENST00000398073 FBXO36Q8NEA4 188 aa17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms