RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393389.7

ANKRD42-202, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 4,066 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-202ENST00000393389 CD302Q8IX05 232 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 MICALL2Q8IY33 904 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 RCOR2Q8IZ40 523 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 ARMC2Q8NEN0 867 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 AGAP11Q8TF27 550 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 PIK3R5Q8WYR1 880 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 OTUD5Q96G74 571 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 TTC25Q96NG3 672 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 ACAD9Q9H845 621 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 ARMCX1Q9P291 453 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 AGAP1Q9UPQ3 857 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 PROSCO94903 275 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 TNFRSF8P28908 595 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 PGM1P36871 562 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 RTKN2Q8IZC4 609 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 FBXO36Q8NEA4 188 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 THTPAQ9BU02 230 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 DNAI2Q9GZS0 605 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 DEFB129Q9H1M3 183 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 H3BRJ5 948 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 WDR46O15213 610 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 MAP3K7O43318 606 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 SNX3O60493 162 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 SKIP12755 728 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 VCAM1P19320 739 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 CYP3A7P24462 503 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 EPHB2P29323 1055 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 COBLL1Q53SF7 1204 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 DCAF12L1Q5VU92 463 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 NLRP9Q7RTR0 991 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 CRLF3Q8IUI8 442 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 NETO2Q8NC67 525 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 PGM2Q96G03 612 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 SCN11AQ9UI33 1791 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 B2RBV5 119 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 O00370 1275 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC4A1P02730 911 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 KRT7P08729 469 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 LCP1P13796 627 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 ADRA1DP25100 572 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 CLK2P49760 499 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 TAS2R40P59535 323 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 CCDC125Q86Z20 511 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF606Q8WXB4 792 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 CEP41Q9BYV8 373 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 SCOCQ9UIL1 159 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 TRIM49D1C9J1S8 452 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 EXTL3O43909 919 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 CYP3A4P08684 503 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 SDC4P31431 198 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 CLCN3P51790 818 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC20A2Q08357 652 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 ITKQ08881 620 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 RGS9BPQ6ZS82 235 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC26A7Q8TE54 656 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 CDKL2Q92772 493 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 SPATA33Q96N06 139 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 KLC2Q9H0B6 622 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 KDM4CQ9H3R0 1056 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 SNX9Q9Y5X1 595 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 SNED1Q8TER0 1413 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 DUOX1Q9NRD9 1551 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 KIF1AQ12756 1690 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 P4HA2O15460 535 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 ARL4AP40617 200 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 CNTN2Q02246 1040 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 NME3Q13232 169 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 PGM5Q15124 567 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 KLHL38Q2WGJ6 581 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 FAM47CQ5HY64 1035 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 HYIQ5T013 277 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 RSPH3Q86UC2 560 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC25A41Q8N5S1 370 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 TEX13BQ9BXU2 312 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 WHRNQ9P202 907 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNRF3Q9ULT6 936 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 LAMA4Q16363 1823 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 NEMP1O14524 444 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 PGK2P07205 417 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC12A2P55011 1212 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD42-202ENST00000393389 MARSP56192 900 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms