RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373619.7

CITED1-202, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 886 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-202ENST00000373619 SLFN12LQ6IEE8 588 aa15.21■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 TSSK4Q6SA08 328 aa15.21■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 THEM5Q8N1Q8 247 aa15.21■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 SHKBP1Q8TBC3 707 aa15.21■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 NELL1Q92832 810 aa15.21■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 ZSWIM3Q96MP5 696 aa15.21■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 PANK2Q9BZ23 570 aa15.21■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 ATXN3LQ9H3M9 355 aa15.21■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 DERAQ9Y315 318 aa15.21■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
CITED1-202ENST00000373619 CACNA1AO00555 2505 aa15.2■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 COL4A2P08572 1712 aa15.2■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 DMDP11532 3685 aa15.2■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 A0A087X0B3 334 aa15.2■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 TRAK2O60296 914 aa15.2■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 PPP6R2O75170 966 aa15.2■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 GJA1P17302 382 aa15.2■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 CCNE1P24864 410 aa15.2■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 CNR2P34972 360 aa15.2■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP15.2■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 PLCB2Q00722 1185 aa15.2■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 BECN1Q14457 450 aa15.2■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 TMEM132DQ14C87 1099 aa15.2■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 ZBTB6Q15916 424 aa15.2■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 SPATA1Q5VX52 437 aa15.2■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 PRR23BQ6ZRT6 265 aa15.2■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 SPEM1Q8N4L4 309 aa15.2■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 RAD54LQ92698 747 aa15.2■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 KCNN1Q92952 543 aa15.2■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 PSMG2Q969U7 264 aa15.2■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 REEP2Q9BRK0 252 aa15.2■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 OBP2AQ9NY56 170 aa15.2■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 MTMR11A4FU01 709 aa15.19■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 LRP3O75074 770 aa15.19■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 YEATS4O95619 227 aa15.19■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 PIGRP01833 764 aa15.19■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 OR4Q2P0C623 313 aa15.19■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 CDC25CP30307 473 aa15.19■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 DDIT3P35638 169 aa15.19■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 TNFSF9P41273 254 aa15.19■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 LILRA4P59901 499 aa15.19■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 FCHO2Q0JRZ9 810 aa15.19■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 CENPPQ6IPU0 288 aa15.19■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 EXOC4Q96A65 974 aa15.19■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 SENP8Q96LD8 212 aa15.19■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 RTKNQ9BST9 563 aa15.19■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 ASB7Q9H672 318 aa15.19■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 RCOR1Q9UKL0 485 aa15.19■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa15.19■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 TSC2P49815 1807 aa15.18■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 A0A0B4J269 797 aa15.18■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 MOSPD3O75425 235 aa15.18■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 GABRR2P28476 465 aa15.18■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 TAF6P49848 677 aa15.18■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 AMPD2Q01433 879 aa15.18■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 FZD5Q13467 585 aa15.18■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 MGAT5BQ3V5L5 792 aa15.18■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 GPR158Q5T848 1215 aa15.18■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 ADALQ6DHV7 355 aa15.18■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 JADE1Q6IE81 842 aa15.18■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 SHC4Q6S5L8 630 aa15.18■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 SYNPOQ8N3V7 929 aa15.18■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 PCDHA7Q9UN72 937 aa15.18■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 C2CD2Q9Y426 696 aa15.18■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 SLC38A8A6NNN8 435 aa15.17■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 CHRNB1P11230 501 aa15.17■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 TXLNAP40222 546 aa15.17■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 ZNF131P52739 623 aa15.17■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 POSTNQ15063 836 aa15.17■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 SLC39A12Q504Y0 691 aa15.17■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 RRAGBQ5VZM2 374 aa15.17■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 C9orf57Q5W0N0 161 aa15.17■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 ATL3Q6DD88 541 aa15.17■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 TMC8Q8IU68 726 aa15.17■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 ATAD1Q8NBU5 361 aa15.17■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 SPPL2BQ8TCT7 592 aa15.17■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 BPIFB1Q8TDL5 484 aa15.17■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 ZNF560Q96MR9 790 aa15.17■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 HAPLN2Q9GZV7 340 aa15.17■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 DNAJC25Q9H1X3 360 aa15.17■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 CCDC39Q9UFE4 941 aa15.17■□□□□ 0.02
CITED1-202ENST00000373619 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms