RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 RMDN2Q96LZ7 410 aa22.7■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 AS3MTQ9HBK9 375 aa22.7■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.7■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 PNMA3Q9UL41 463 aa22.7■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa22.7■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 LSM8O95777 96 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
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PTDSS1-201ENST00000337004 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
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PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF132P52740 706 aa22.7■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 AP3M2P53677 418 aa22.7■■□□□ 1.22
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PTDSS1-201ENST00000337004 PPCSQ9HAB8 311 aa22.7■■□□□ 1.22
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PTDSS1-201ENST00000337004 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.69■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 MAGEB2O15479 319 aa22.69■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP22.69■■□□□ 1.22
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PTDSS1-201ENST00000337004 TCF4P15884 667 aa22.69■■□□□ 1.22
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PTDSS1-201ENST00000337004 TFDP3Q5H9I0 405 aa22.69■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 MCEEQ96PE7 176 aa22.69■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 SMC6Q96SB8 1091 aa22.69■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
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PTDSS1-201ENST00000337004 KRT15P19012 456 aa22.69■■□□□ 1.22
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PTDSS1-201ENST00000337004 PTPN7P35236 360 aa22.69■■□□□ 1.22
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PTDSS1-201ENST00000337004 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
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PTDSS1-201ENST00000337004 TMEM35BQ8NCS4 154 aa22.69■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 FBF1Q8TES7 1133 aa22.69■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 TRABDQ9H4I3 376 aa22.69■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 TMEM134Q9H6X4 195 aa22.69■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 ACAD9Q9H845 621 aa22.69■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 VPS37BQ9H9H4 285 aa22.69■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 STK32BQ9NY57 414 aa22.69■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 F8VP50 259 aa22.68■■□□□ 1.22
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PTDSS1-201ENST00000337004 SPAG7O75391 227 aa22.68■■□□□ 1.22
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PTDSS1-201ENST00000337004 ECHDC2Q86YB7 292 aa22.68■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF280CQ8ND82 737 aa22.68■■□□□ 1.22
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PTDSS1-201ENST00000337004 KIF2BQ8N4N8 673 aa22.68■■□□□ 1.22
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PTDSS1-201ENST00000337004 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa22.67■■□□□ 1.22
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PTDSS1-201ENST00000337004 CCNB1P14635 433 aa22.67■■□□□ 1.22
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PTDSS1-201ENST00000337004 PDE4CQ08493 712 aa22.67■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa22.67■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.67■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 SETDB1Q15047 1291 aa22.67■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 ZBED8Q8IZ13 594 aa22.67■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 UBR7Q8N806 425 aa22.67■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
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PTDSS1-201ENST00000337004 EBF2Q9HAK2 575 aa22.67■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 SHOC2Q9UQ13 582 aa22.67■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa22.67■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 ASS1P00966 412 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 KRT16P08779 473 aa22.67■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 TGFB2P61812 414 aa22.67■■□□□ 1.22
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PTDSS1-201ENST00000337004 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
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PTDSS1-201ENST00000337004 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.67■■□□□ 1.22
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PTDSS1-201ENST00000337004 SGK1O00141 431 aa22.66■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 UNC5CO95185 931 aa22.66■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 CST3P01034 146 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 KCNA3P22001 575 aa22.66■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 MSH2P43246 934 aa22.66■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 SEZ6Q53EL9 994 aa22.66■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 PCGF5Q86SE9 256 aa22.66■■□□□ 1.22
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