RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325438.12

PACS2-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS2, Length 3,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2-201ENST00000325438 VTI1AQ96AJ9 217 aa25.17■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 APOL6Q9BWW8 343 aa25.17■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 PDP2Q9P2J9 529 aa25.17■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 KLHL33A6NCF5 533 aa25.16■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 SHMT1P34896 483 aa25.16■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 MFSD7Q6UXD7 560 aa25.16■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 SCUBE1Q8IWY4 988 aa25.16■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 GPR88Q9GZN0 384 aa25.16■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa25.16■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa25.16■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 NPTXRO95502 500 aa25.16■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 GNA15P30679 374 aa25.16■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 LIG4P49917 911 aa25.16■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 NUDCD3Q8IVD9 361 aa25.16■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 HSPH1Q92598 858 aa25.16■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 NDNQ99608 321 aa25.16■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 ALAS1P13196 640 aa25.16■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 ACOT2P49753 483 aa25.16■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 CCNG2Q16589 344 aa25.16■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 GSDMBQ8TAX9 411 aa25.16■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 MCEEQ96PE7 176 aa25.16■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 TUFT1Q9NNX1 390 aa25.16■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 CFLARO15519 480 aa25.15■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 GNAZP19086 355 aa25.15■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 FAXCQ5TGI0 409 aa25.15■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 WDR35Q9P2L0 1181 aa25.15■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 PDE5AO76074 875 aa25.15■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 OTOP1Q7RTM1 612 aa25.15■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 CRLF3Q8IUI8 442 aa25.15■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 C10orf82Q8WW14 230 aa25.15■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 SREBF1P36956 1147 aa25.15■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 USP6NLQ92738 828 aa25.15■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 PPP1R36Q96LQ0 422 aa25.15■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 MECRQ9BV79 373 aa25.15■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 NMUR2Q9GZQ4 415 aa25.15■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 TAS2R1Q9NYW7 299 aa25.15■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 CCNFP41002 786 aa25.14■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 CLK2P49760 499 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 STAT2P52630 851 aa25.14■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 SCYL2Q6P3W7 929 aa25.14■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa25.14■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 RSPH3Q86UC2 560 aa25.14■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 MCOLN2Q8IZK6 566 aa25.14■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 TMOD2Q9NZR1 351 aa25.14■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 ADRB2P07550 413 aa25.14■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 T-ENOLP0DO92 83 aa25.14■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 SV2AQ7L0J3 742 aa25.14■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 SH3TC2Q8TF17 1288 aa25.14■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 OPTNQ96CV9 577 aa25.14■■□□□ 1.62
PACS2-201ENST00000325438 CENPCQ03188 943 aa25.14■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 ACVR2BQ13705 512 aa25.14■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa25.14■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 MIPEPQ99797 713 aa25.14■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 C2CD2LO14523 706 aa25.13■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 RNF8O76064 485 aa25.13■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 BMPR2Q13873 1038 aa25.13■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 CHI3L2Q15782 390 aa25.13■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 FRMPD4Q14CM0 1322 aa25.13■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 AQP5P55064 265 aa25.13■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 PPP2R5DQ14738 602 aa25.13■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 BMT2Q1RMZ1 405 aa25.13■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 CEP170P1Q96L14 293 aa25.13■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 SLC1A1P43005 524 aa25.13■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 CCDC15Q0P6D6 951 aa25.13■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 FAM71AQ8IYT1 594 aa25.13■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 TRIM11Q96F44 468 aa25.13■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 IWS1Q96ST2 819 aa25.13■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 WDR18Q9BV38 432 aa25.13■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 PRR12Q9ULL5 1215 aa25.13■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 DNAJC6O75061 913 aa25.12■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 SCNN1BP51168 640 aa25.12■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 HIC1Q14526 733 aa25.12■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 LBRQ14739 615 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 AOC3Q16853 763 aa25.12■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 KLHL38Q2WGJ6 581 aa25.12■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 SEZ6Q53EL9 994 aa25.12■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 NME8Q8N427 588 aa25.12■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 FAM71DQ8N9W8 422 aa25.12■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 FAM81BQ96LP2 452 aa25.12■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 TRIM49D1C9J1S8 452 aa25.12■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 CYP1A2P05177 515 aa25.12■■□□□ 1.61
PACS2-201ENST00000325438 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms