RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DNAAF5Q86Y56 855 aa25.48■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF560Q96MR9 790 aa25.48■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TWNKQ96RR1 684 aa25.48■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NME7Q9Y5B8 376 aa25.48■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 COL4A6Q14031 1691 aa25.48■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PTPRSQ13332 1948 aa25.48■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa25.47■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TBKBP1A7MCY6 615 aa25.47■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 I3L4J1 428 aa25.47■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 WDR5P61964 334 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DSC1Q08554 894 aa25.47■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SOWAHAQ2M3V2 549 aa25.47■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C10orf76Q5T2E6 689 aa25.47■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TAF3Q5VWG9 929 aa25.47■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EPS8L1Q8TE68 723 aa25.47■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 WHAMMQ8TF30 809 aa25.47■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM81BQ96LP2 452 aa25.47■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DUSP10Q9Y6W6 482 aa25.47■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TUBB2AQ13885 445 aa25.47■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF365Q70YC5 407 aa25.47■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 VPS36Q86VN1 386 aa25.47■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 COLGALT2Q8IYK4 626 aa25.47■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SYT11Q9BT88 431 aa25.47■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TUBB2BQ9BVA1 445 aa25.47■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PDCL3Q9H2J4 239 aa25.47■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CNTN6Q9UQ52 1028 aa25.47■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CYP11B1P15538 503 aa25.46■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FPGSQ05932 587 aa25.46■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SV2CQ496J9 727 aa25.46■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa25.46■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 L1RE1Q9UN81 338 aa25.46■■□□□ 1.67
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 B3GAT3O94766 335 aa25.45■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KIF4AO95239 1232 aa25.45■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 P4HA1P13674 534 aa25.45■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PNPLA4P41247 253 aa25.45■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BRCC3P46736 316 aa25.45■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF132P52740 706 aa25.45■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PALB2Q86YC2 1186 aa25.45■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GDAP2Q9NXN4 497 aa25.45■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MRFAP1Q9Y605 127 aa25.45■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CFHP08603 1231 aa25.44■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CHRNB2P17787 502 aa25.44■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RPL9P32969 192 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PBX3P40426 434 aa25.44■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GLYCTKQ8IVS8 523 aa25.44■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa25.44■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DPF3Q92784 378 aa25.44■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TOP1MTQ969P6 601 aa25.44■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ELOVL4Q9GZR5 314 aa25.44■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KANSL3Q9P2N6 904 aa25.44■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MACROD2A1Z1Q3 448 aa25.44■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP25.44■■□□□ 1.661e-6■■□□□ 13.3
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CILPO75339 1184 aa25.44■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DGKIO75912 1065 aa25.44■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PFKMP08237 780 aa25.44■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MMEP08473 750 aa25.44■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR1G1P47890 313 aa25.44■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NDST1P52848 882 aa25.44■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP25.44■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TIGD5Q53EQ6 642 aa25.44■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZSWIM1Q9BR11 485 aa25.44■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HTATIP2Q9BUP3 242 aa25.44■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CYP3A43Q9HB55 503 aa25.44■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZBBXA8MT70 800 aa25.43■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CYB561D2O14569 222 aa25.43■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RAD23BP54727 409 aa25.43■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SENP8Q96LD8 212 aa25.43■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AGPAT1Q99943 283 aa25.43■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP25.43■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AMHP03971 560 aa25.42■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM240Q5SV17 173 aa25.42■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OSTM1Q86WC4 334 aa25.42■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PDCL2Q8N4E4 241 aa25.42■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAXDC2Q96IV6 333 aa25.42■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PCDHB18PQ96TA0 734 aa25.42■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LPIN3Q9BQK8 851 aa25.42■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NAGPAQ9UK23 515 aa25.42■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NENFQ9UMX5 172 aa25.42■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TACC1O75410 805 aa25.42■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FGBP02675 491 aa25.42■■□□□ 1.66
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BRD2P25440 801 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms