RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258243.6

URB2-201, Transcript of URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene URB2, Length 5,613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URB2-201ENST00000258243 SP3Q02447 781 aa11.41□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 SLC9A5Q14940 896 aa11.41□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 CATSPER3Q86XQ3 398 aa11.41□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 TC2NQ8N9U0 490 aa11.41□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 A0A1B0GTH6 734 aa11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 PODXLO00592 558 aa11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 VTNP04004 478 aa11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 MUTP22033 750 aa11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 SREBF1P36956 1147 aa11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 GRIN1Q05586 938 aa11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP11.4□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 28.1
URB2-201ENST00000258243 KIZQ2M2Z5 673 aa11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 C10orf120Q5SQS8 335 aa11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 SLC30A9Q6PML9 568 aa11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 DENND6AQ8IWF6 608 aa11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 ASAP3Q8TDY4 903 aa11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 APEX2Q9UBZ4 518 aa11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 MYMKA6NI61 221 aa11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 NFIBO00712 420 aa11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 ZNF185O15231 689 aa11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 PDHA1P08559 390 aa11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 NAMPTP43490 491 aa11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 TRIM15Q9C019 465 aa11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 EPN3Q9H201 632 aa11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 KCNQ5Q9NR82 932 aa11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 WDR91A4D1P6 747 aa11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 RTN2O75298 545 aa11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 HLA-DRAP01903 254 aa11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 TGFB3P10600 412 aa11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 PRAMEP78395 509 aa11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 MFSD10Q14728 455 aa11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 IL31Q6EBC2 164 aa11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 POTEAQ6S8J7 498 aa11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 RASGRP2Q7LDG7 609 aa11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 KRT73Q86Y46 540 aa11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 SPATA17Q96L03 361 aa11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 TBX20Q9UMR3 447 aa11.4□□□□□ -0.58
URB2-201ENST00000258243 TOM1L1O75674 476 aa11.4□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 CAPN15O75808 1086 aa11.4□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 FAM200BP0CF97 657 aa11.4□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 FMO5P49326 533 aa11.4□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 DEFA1P59665 94 aa11.4□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 DEFA3P59666 94 aa11.4□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 ANO4Q32M45 955 aa11.4□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 FAM47EQ6ZV65 393 aa11.4□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 TSSK1BQ9BXA7 367 aa11.4□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 WNT8AQ9H1J5 351 aa11.4□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 TMEM8AQ9HCN3 771 aa11.4□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 FAM49BQ9NUQ9 324 aa11.4□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa11.4□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 TMEM88BA6NKF7 163 aa11.39□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 H3BRB1 525 aa11.39□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 DNAJC6O75061 913 aa11.39□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 RAB27AP51159 221 aa11.39□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 RAD9BQ6WBX8 426 aa11.39□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 NAGPAQ9UK23 515 aa11.39□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 ITGB3P05106 788 aa11.39□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 MDH1P40925 334 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 ARHGDIAP52565 204 aa11.39□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 ACVR2BQ13705 512 aa11.39□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 HPS3Q969F9 1004 aa11.39□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 NIF3L1Q9GZT8 377 aa11.39□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 LRRC4BQ9NT99 713 aa11.39□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 KANSL3Q9P2N6 904 aa11.39□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 DSEQ9UL01 958 aa11.39□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 GRID2IPA4D2P6 1211 aa11.39□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 CABYRO75952 493 aa11.39□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 ARP10275 920 aa11.39□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 GRIK4Q16099 956 aa11.39□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 MPZL3Q6UWV2 235 aa11.39□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 TTC8Q8TAM2 541 aa11.39□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 CCT8L2Q96SF2 557 aa11.39□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 CHP1Q99653 195 aa11.39□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 PDCD2LQ9BRP1 358 aa11.39□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 SAYSD1Q9NPB0 183 aa11.39□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 CFAP73A6NFT4 308 aa11.39□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 SYCE1LA8MT33 242 aa11.39□□□□□ -0.59
URB2-201ENST00000258243 DCTN3O75935 186 aa11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms