RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 CILPO75339 1184 aa25.41■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 STAU1O95793 577 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 DR1Q01658 176 aa25.41■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 SNX27Q96L92 541 aa25.41■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 IP6K2Q9UHH9 426 aa25.41■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 PHF2O75151 1096 aa25.41■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 NME8Q8N427 588 aa25.41■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 TTC39CQ8N584 583 aa25.41■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 ZBTB9Q96C00 473 aa25.41■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM176AQ96HP8 235 aa25.41■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 RAB17Q9H0T7 212 aa25.41■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 LHX5Q9H2C1 402 aa25.41■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 STRIP2Q9ULQ0 834 aa25.41■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 H3BQF6 201 aa25.4■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 ORC1Q13415 861 aa25.4■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 GNASQ5JWF2 1037 aa25.4■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 DENND1BQ6P3S1 775 aa25.4■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 DCUN1D2Q6PH85 259 aa25.4■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC4A11Q8NBS3 891 aa25.4■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 WHAMMQ8TF30 809 aa25.4■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 ZIC5Q96T25 663 aa25.4■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 MED4Q9NPJ6 270 aa25.4■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP25.4■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 LCMT1Q9UIC8 334 aa25.4■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 HES2Q9Y543 173 aa25.4■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 CHRNA3P32297 505 aa25.4■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 SSR1P43307 286 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 RHOT1Q8IXI2 618 aa25.4■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 TRPV1Q8NER1 839 aa25.4■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 BEST2Q8NFU1 509 aa25.4■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM40Q8WWA1 233 aa25.4■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 SPC25Q9HBM1 224 aa25.4■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 USTQ9Y2C2 406 aa25.4■■□□□ 1.66
RPUSD1-201ENST00000007264 PSTPIP1O43586 416 aa25.39■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 TAP1Q03518 808 aa25.39■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 TRADDQ15628 312 aa25.39■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 WDTC1Q8N5D0 677 aa25.39■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 APOL6Q9BWW8 343 aa25.39■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa25.39■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 HMGXB4Q9UGU5 601 aa25.39■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 RASAL2Q9UJF2 1139 aa25.39■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 PCNTO95613 3336 aa25.39■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 GOLGA6BA6NDN3 693 aa25.38■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 GJB6O95452 261 aa25.38■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 ALDH1A1P00352 501 aa25.38■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 MAN1A1P33908 653 aa25.38■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 TWNKQ96RR1 684 aa25.38■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 ELOVL4Q9GZR5 314 aa25.38■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 MYADML2A6NDP7 307 aa25.38■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 RECQL4O94761 1208 aa25.38■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 CYBAP13498 195 aa25.38■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP25.38■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 TAF2Q6P1X5 1199 aa25.38■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 PRELID2Q8N945 189 aa25.38■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 MCEEQ96PE7 176 aa25.38■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM187AA6NFU0 413 aa25.37■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM191CA6NGB0 347 aa25.37■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM153BP0C7A2 387 aa25.37■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 GJA9P57773 515 aa25.37■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM193AP78312 1265 aa25.37■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM153CQ494X1 144 aa25.37■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 CYP4A22Q5TCH4 519 aa25.37■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM71BQ8TC56 605 aa25.37■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 TRIB2Q92519 343 aa25.37■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 SYNCQ9H7C4 482 aa25.37■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM114A2Q9NRY5 505 aa25.37■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM153AQ9UHL3 310 aa25.37■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 GABRQQ9UN88 632 aa25.37■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM88BA6NKF7 163 aa25.36■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 VDRP11473 427 aa25.36■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 HOXC8P31273 242 aa25.36■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 FLT3LGP49771 235 aa25.36■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 INCA1Q0VD86 236 aa25.36■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 SGO2Q562F6 1265 aa25.36■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa25.36■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP25.36■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 CCDC50Q8IVM0 306 aa25.36■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 C3orf20Q8ND61 904 aa25.36■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 MAIP1Q8WWC4 291 aa25.36■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 C18orf8Q96DM3 657 aa25.36■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 HHIPL1Q96JK4 782 aa25.36■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 RUNDC3BQ96NL0 473 aa25.36■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 TRIM51Q9BSJ1 452 aa25.36■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 CNTN3Q9P232 1028 aa25.36■■□□□ 1.65
RPUSD1-201ENST00000007264 M0QZ92 97 aa25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms