RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006275.8

TRAPPC6A-201, Transcript of trafficking protein particle complex 6A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC6A, Length 805 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ARPP19P56211 112 aa20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLC8B1Q6J4K2 584 aa20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC6A-201ENST00000006275 VITQ6UXI7 678 aa20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SMARCD2Q92925 531 aa20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC6A-201ENST00000006275 UROC1Q96N76 676 aa20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ACCSQ96QU6 501 aa20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC6A-201ENST00000006275 STRA6Q9BX79 667 aa20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CYP4F11Q9HBI6 524 aa20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TRPV5Q9NQA5 729 aa20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC6A-201ENST00000006275 EXOC7Q9UPT5 735 aa20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 OGTO15294 1046 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HRO43593 1189 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MICAL2O94851 1124 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CLTAP09496 248 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLFN14P0C7P3 912 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CCNE1P24864 410 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DMWDQ09019 674 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ALCAMQ13740 583 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KYAT1Q16773 422 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 UPP1Q16831 310 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 XKR4Q5GH76 650 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CYP4A22Q5TCH4 519 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLFN12LQ6IEE8 588 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CNNM4Q6P4Q7 775 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLC39A4Q6P5W5 647 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CD300LGQ6UXG3 332 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ALKAL1Q6UXT8 129 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 C3orf58Q8NDZ4 430 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 BLZF1Q9H2G9 400 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CNTN3Q9P232 1028 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 USP25Q9UHP3 1055 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HPSEQ9Y251 543 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZFHX4Q86UP3 3567 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CEP295Q9C0D2 2601 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 A0A1W2PQ27 194 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 A0A1W2PQ64 194 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 A0A1W2PQD8 194 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ANKRD63C9JTQ0 380 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZNF263O14978 683 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ABLIM3O94929 683 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CHRNB1P11230 501 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ATF2P15336 505 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CASP1P29466 404 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CCR2P41597 374 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SYKP43405 635 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CASP5P51878 434 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 IL31Q6EBC2 164 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TCEAL8Q8IYN2 117 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ELMOD1Q8N336 334 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SPEM1Q8N4L4 309 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FSIP1Q8NA03 581 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZSWIM3Q96MP5 696 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MSTO1Q9BUK6 570 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLC38A7Q9NVC3 462 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 INSL5Q9Y5Q6 135 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FAM208BQ5VWN6 2430 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ATRXP46100 2492 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SDK1Q7Z5N4 2213 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 A0A0B4J269 797 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CXCL8P10145 99 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KCNE1P15382 129 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CNR2P34972 360 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TNFSF9P41273 254 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 VIPR2P41587 438 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NDUFA8P51970 172 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KCNA1Q09470 495 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GAS6Q14393 721 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLC10A6Q3KNW5 377 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 IQCEQ6IPM2 695 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 UNC13DQ70J99 1090 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CEP68Q76N32 757 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LONP2Q86WA8 852 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SYCP3Q8IZU3 236 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 IKZF4Q9H2S9 585 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TISP43B9A030 160 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SEC24AO95486 1093 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CUL4BQ13620 913 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LRRC32Q14392 662 aa20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms