RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000043498.7

Hdac3-201, Transcript of Histone deacetylase 3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hdac3, Length 2,004 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Mrpl2Q9D773 306 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Klhl40Q9D783 621 aa24.58■■□□□ 1.53
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Tcirg1Q9JHF5 834 aa24.58■■□□□ 1.53
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Scn5aQ9JJV9 2019 aa24.58■■□□□ 1.53
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Gm10110D3Z5M2 615 aa24.57■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Pax3P24610 479 aa24.57■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 RabggtbP53612 339 aa24.57■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Pkn1P70268 946 aa24.57■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Rad54lP70270 747 aa24.57■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Ppp1r12cQ3UMT1 782 aa24.57■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Tmem232Q5K6N0 675 aa24.57■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Gas8Q60779 478 aa24.57■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Lamb3Q61087 1168 aa24.57■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Top6blJ3QMY9 579 aa24.57■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Cetn1P41209 172 aa24.57■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Nlrc4Q3UP24 1024 aa24.57■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Sec31aQ3UPL0 1230 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 MrgpreQ91ZB7 310 aa24.57■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Bnip3lQ9Z2F7 218 aa24.57■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 CitP49025 2055 aa24.57■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Lrrc73B2RWC4 316 aa24.56■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Scgb2b19J3QM75 112 aa24.56■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 PkmP52480 531 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Ppp4r3cQ3V0Y1 813 aa24.56■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 MmeQ61391 750 aa24.56■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Papd5Q68ED3 633 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Acvr1cQ8K348 493 aa24.56■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Stap2Q8R0L1 411 aa24.56■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Tnni1Q9WUZ5 187 aa24.56■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Sf3b1Q99NB9 1304 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 BhmtO35490 407 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Grem1O70326 184 aa24.56■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Cdc25cP48967 447 aa24.56■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Enpp3Q6DYE8 874 aa24.56■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Zdhhc19Q810M5 347 aa24.56■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Wdr35Q8BND3 1181 aa24.56■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Ints6lQ8BND4 861 aa24.56■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Themis3Q9CU24 569 aa24.56■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Dock1Q8BUR4 1865 aa24.55■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Malrd1A2AJX4 2123 aa24.55■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Scgb2b11A0A087WR49 112 aa24.55■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Sclt1G5E861 688 aa24.55■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 PurbO35295 324 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 P01650 108 aa24.55■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 P01653 108 aa24.55■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Lsp1P19973 330 aa24.55■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Smyd1P97443 490 aa24.55■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 FdxrQ61578 494 aa24.55■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 PostnQ62009 838 aa24.55■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Olfr412Q7TRW7 312 aa24.55■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Tmprss4Q8VCA5 435 aa24.55■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Asb11Q9CQ31 323 aa24.55■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Desi2Q9D291 194 aa24.55■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 4930402K13RikB1AW18 415 aa24.54■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Znf568E9PYI1 671 aa24.54■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Lmod3E9QA62 571 aa24.54■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Ctnnd1P30999 938 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Ifnar1P33896 590 aa24.54■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Psmc1P62192 440 aa24.54■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Maip1Q8BHE8 291 aa24.54■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Tmem30aQ8VEK0 364 aa24.54■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Fam217aQ9D9W6 419 aa24.54■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Rfc2Q9WUK4 349 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Hoxd8P23463 289 aa24.54■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 YwhahP68510 246 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Ttc39dQ0VF76 604 aa24.54■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Pank2Q3U4S0 443 aa24.54■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Mvb12bQ6KAU4 317 aa24.54■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Olfr670Q7TRP3 312 aa24.54■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 WhrnQ80VW5 918 aa24.54■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 ToporsQ80Z37 1033 aa24.54■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Mical2Q8BML1 960 aa24.54■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Fam163bQ8BUM6 167 aa24.54■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Klhl36Q8R124 613 aa24.54■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 MajinQ9D992 256 aa24.54■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Gm13212B1ASQ7 799 aa24.53■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Cdk14O35495 469 aa24.53■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Itm2bO89051 266 aa24.53■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Mgat1P27808 447 aa24.53■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Resp18P47939 175 aa24.53■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Gad1P48318 593 aa24.53■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Fam92bQ3V2J0 292 aa24.53■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Ddx3xQ62167 662 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Tbc1d12Q6A039 696 aa24.53■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Cfap97Q6ZPR1 541 aa24.53■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 MtrrQ8C1A3 696 aa24.53■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Fam49bQ921M7 324 aa24.53■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Ergic2Q9CR89 377 aa24.53■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Atg7Q9D906 698 aa24.53■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Znf394Q9Z1D9 521 aa24.53■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Igkv17-121A0A0G2JFA8 117 aa24.52■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Cpne7Q0VE82 557 aa24.52■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Oca2Q62052 833 aa24.52■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Gpsm1Q6IR34 673 aa24.52■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Nipal1Q8BMW7 416 aa24.52■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 PrelpQ9JK53 378 aa24.52■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Tspan3Q9QY33 253 aa24.52■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Psma7Q9Z2U0 248 aa24.52■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Atp2c2A7L9Z8 944 aa24.52■■□□□ 1.52
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Stat4P42228 749 aa24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.1 ms