RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scn1aA2APX8 2009 aa13.38□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Myo1eE9Q634 1107 aa13.38□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pex5O09012 639 aa13.38□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RxrbP28704 520 aa13.38□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trim80Q3V061 624 aa13.38□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ctc1Q5SUQ9 1212 aa13.38□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp3a16Q64481 504 aa13.38□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnajc8Q6NZB0 253 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Inpp4bQ6P1Y8 924 aa13.38□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GmipQ6PGG2 971 aa13.38□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stk38lQ7TSE6 464 aa13.38□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vat1lQ80TB8 417 aa13.38□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 B3glctQ8BHT6 489 aa13.38□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 OgtQ8CGY8 1046 aa13.38□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ablim1Q8K4G5 861 aa13.38□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cplx3Q8R1B5 158 aa13.38□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cpa5Q8R4H4 436 aa13.38□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tcirg1Q9JHF5 834 aa13.38□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Phf2Q9WTU0 1096 aa13.38□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sbf1Q6ZPE2 1867 aa13.38□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cfap221A9Q751 836 aa13.37□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r87E9PZX4 848 aa13.37□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Casq2O09161 415 aa13.37□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 IppP28575 584 aa13.37□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ephb2P54763 986 aa13.37□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Psmc4P54775 418 aa13.37□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CcnjlQ5SRT8 387 aa13.37□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FancbQ5XJY6 703 aa13.37□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zbtb17Q60821 794 aa13.37□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ddx4Q61496 702 aa13.37□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SpopQ6ZWS8 374 aa13.37□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tarsl2Q8BLY2 790 aa13.37□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mageb18Q8BQR7 327 aa13.37□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc38a7Q8BWH0 463 aa13.37□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lamtor4Q8CF66 99 aa13.37□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rassf9Q8K342 435 aa13.37□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf830Q8R1N0 363 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HgsQ99LI8 775 aa13.37□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 IqcdQ9D3V1 458 aa13.37□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krt17Q9QWL7 433 aa13.37□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klrc2Q9WTJ9 238 aa13.37□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mbtps1Q9WTZ2 1052 aa13.37□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LctF8VPT3 1931 aa13.37□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 506 aa13.37□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zscan4-ps2A0A1C7CYU6 506 aa13.37□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nup62clA2AG10 272 aa13.37□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TroapB7ZNG4 668 aa13.37□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 IapP03975 557 aa13.37□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp2c39P56656 490 aa13.37□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tbx3P70324 741 aa13.37□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zswim5Q80TC6 1188 aa13.37□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eif4bQ8BGD9 611 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 VcpkmtQ8C436 228 aa13.37□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GneQ91WG8 722 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fkbp6Q91XW8 327 aa13.37□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Armc9Q9D2I5 817 aa13.37□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tacc3Q9JJ11 631 aa13.37□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Msgn1Q9JK54 188 aa13.37□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rabgef1Q9JM13 491 aa13.37□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf804aA2AKY4 1200 aa13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rap1gapA2ALS5 663 aa13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp266E9Q2S7 604 aa13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4933406M09RikG3XA12 479 aa13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Diaph2O70566 1098 aa13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rrm1P07742 792 aa13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Xrcc5P27641 732 aa13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rab21P35282 222 aa13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PctpP53808 214 aa13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4930502E18RikQ14BQ3 236 aa13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SpertQ32MG2 446 aa13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem120bQ3TA38 339 aa13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Palb2Q3U0P1 1104 aa13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GmncQ3URY2 333 aa13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam198aQ3UY90 562 aa13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Abi3bpQ59IW6 1179 aa13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mtus1Q5HZI1 1210 aa13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wnk4Q80UE6 1222 aa13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Crybg3Q80W49 1005 aa13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Usp6nlQ80XC3 819 aa13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pwp2Q8BU03 919 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PreplQ8C167 725 aa13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pih1h3bQ8C6P5 218 aa13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tlr3Q99MB1 905 aa13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tdrd12Q9CWU0 1215 aa13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ftsj3Q9DBE9 838 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Xab2Q9DCD2 855 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atp13a1Q9EPE9 1200 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cpsf3Q9QXK7 684 aa13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm5936A2BG95 728 aa13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm5640A3KG49 728 aa13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Svs3aF2Z472 265 aa13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Art2bO35975 289 aa13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccr5P51682 354 aa13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wfs1P56695 890 aa13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Uhmk1P97343 419 aa13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rmdn3Q3UJU9 470 aa13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ctnna2Q61301 953 aa13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr392Q7TRX6 312 aa13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc26a7Q8R2Z3 656 aa13.36□□□□□ -0.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vps36Q91XD6 386 aa13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 42.1 ms