RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	ERG2	P32352	222 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	SCM4	P32564	187 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	MRPL28	P36527	147 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	RFC2	P40348	353 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	PAU4	P53427	120 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	FSH2	Q05015	223 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	YOL029C	Q08187	201 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	AGC1	Q12482	902 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	COA2	Q3E823	68 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	COA6	Q3E846	104 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
PSH1	YOL054W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	MDH2	P22133	377 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	MRS4	P23500	304 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	YCR101C	P25607	182 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	REC114	P32841	428 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	FIG1	P38224	298 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	YBR096W	P38256	230 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	FLO5	P38894	1075 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	HSP10	P38910	106 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	AIM24	P47127	394 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	YNR048W	P53740	393 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	YPL039W	Q03080	316 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	YDR286C	Q05530	114 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	CRC1	Q12289	327 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	PRR2	Q12310	699 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	PAU1	P0CE88	120 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	PAU14	P0CE89	120 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	PAU6	P0CE90	120 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	PAU18	P0CE91	120 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	PAU8	P0CE92	120 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	PAU11	P0CE93	120 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	MRPL44	P19956	98 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	YCR025C	P25352	136 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	OCH1	P31755	480 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	MNS1	P32906	549 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	PAU13	P38725	120 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	YND1	P40009	630 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	CFD1	P40558	293 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	CYT2	Q00873	224 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	YDC1	Q02896	317 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	PAU10	Q03050	120 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	YDR102C	Q03864	110 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	PAU20	Q08322	120 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	FCY22	Q12119	530 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
PSH1	YOL054W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	YOP1	Q12402	180 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	HUT1	Q12520	339 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	PAU9	Q3E770	120 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	IRA1	P18963	3092 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	COX5B	P00425	151 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	CDC50	P25656	391 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	AHT1	P29589	182 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	RPB7	P34087	171 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	YUH1	P35127	236 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	PRM5	P40476	318 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	PAU5	P43575	122 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	TRM9	P49957	279 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	PAM18	Q07914	168 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	YPL264C	Q08980	353 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	FRE8	Q12209	686 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	RAX2	Q12465	1220 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	BLM10	P43583	2143 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PSH1	YOL054W	PCL1	P24867	279 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	CWP1	P28319	239 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	CPR5	P35176	225 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	UPS2	P35200	230 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	PCP1	P53259	346 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	YDR387C	Q04162	555 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	YOR186W	Q08560	144 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	ERV2	Q12284	196 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	ACP1	P32463	125 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	IRC22	P40006	225 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	ATF1	P40353	525 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PSH1	YOL054W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65

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