RNA–Protein interactions for RNA: YNL231C

PDR16, Transcript of Phosphatidylinositol transfer protein (PITP), yeast

Gene PDR16, Length 1,056 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PDR16	YNL231C	YMC1	P32331	307 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDR16	YNL231C	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PDR16	YNL231C	UTR4	P32626	227 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDR16	YNL231C	FMT1	P32785	401 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDR16	YNL231C	ETR1	P38071	380 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDR16	YNL231C	SDS24	P38314	527 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDR16	YNL231C	YHL049C	P38722	271 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDR16	YNL231C	IPT1	P38954	527 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDR16	YNL231C	GAA1	P39012	614 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDR16	YNL231C	FAA2	P39518	744 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDR16	YNL231C	SPC25	P40014	221 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDR16	YNL231C	SNO3	P43544	222 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDR16	YNL231C	SFT1	P43682	97 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDR16	YNL231C	AIM25	P47140	327 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDR16	YNL231C	TTI2	P47168	421 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDR16	YNL231C	UBC12	P52491	188 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDR16	YNL231C	MDM34	P53083	459 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDR16	YNL231C	YIP4	P53093	235 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDR16	YNL231C	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PDR16	YNL231C	ATP23	P53722	227 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDR16	YNL231C	APJ1	P53940	528 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDR16	YNL231C	UPS1	Q05776	175 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDR16	YNL231C	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PDR16	YNL231C	YDL009C	Q12210	107 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDR16	YNL231C	PST1	Q12355	444 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDR16	YNL231C	ORT1	Q12375	292 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDR16	YNL231C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDR16	YNL231C	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDR16	YNL231C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PDR16	YNL231C	FUN14	P18411	198 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	MST28	P39552	234 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	DLS1	P40366	167 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	XBP1	P40489	647 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	SAS2	P40963	338 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	MRH4	P53166	561 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	VPS71	Q03433	280 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	INP1	Q03694	420 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	GAL83	Q04739	417 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	THP1	Q08231	455 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	MCH4	Q08268	501 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	PRR2	Q12310	699 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	EAF3	Q12432	401 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	RAD6	P06104	172 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	HAP3	P13434	144 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	TFS1	P14306	219 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	MED6	P38782	295 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	PAN6	P40459	309 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	YFR054C	P43622	192 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	GON7	P46984	123 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	THI74	Q04083	370 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	ARR3	Q06598	404 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	SWC7	Q06707	132 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	YDL057W	Q07379	328 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	HUT1	Q12520	339 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	COX1	P00401	534 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	HEM2	P05373	342 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	SNF4	P12904	322 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	MSI1	P13712	422 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	SNC1	P31109	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	COX13	P32799	129 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	SSS1	P35179	80 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	SNN1	P48232	102 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	UBP8	P50102	471 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	CAB4	P53332	305 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	WSC2	P53832	503 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	YDL218W	Q07629	317 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	SRP21	P32342	167 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	YKL102C	P34249	101 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	HPA3	P39979	161 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	YIL024C	P40543	189 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	RRT5	P43607	289 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	IRC15	Q02733	499 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	RSM10	Q03201	203 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	BSP1	Q06604	576 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	YLR042C	Q07990	161 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	DGA1	Q08650	418 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	YOR376W	Q08900	122 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	YPR064W	Q12492	139 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	COX10	P21592	462 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	ATG15	P25641	520 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	TOA2	P32774	122 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	YET1	P35723	206 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	TRS20	P38334	175 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	YHK8	P38776	514 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	YIL059C	P40520	121 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDR16	YNL231C	CAT5	P41735	233 aa		4.54	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 48.2 ms