RNA–Protein interactions for RNA: YGL197W

MDS3, Transcript of Putative component of the TOR regulatory pathway, yeastyeast

Gene MDS3, Length 4,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MDS3YGL197W MKK1P32490 508 aa1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W UPS2P35200 230 aa1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W CSG2P35206 410 aa1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W YET1P35723 206 aa1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W ADH5P38113 351 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W YBR062CP38239 180 aa1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W EGT2P42835 1041 aa1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W NSE4P43124 402 aa1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W GPI14P47088 403 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W IBA57P47158 497 aa1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W YGL185CP53100 379 aa1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W RPL22BP56628 122 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W SPG3Q04398 127 aaPredicted RBP1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W RRP40Q08285 240 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W ATG31Q12421 196 aa1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W YLR099W-AQ3E798 87 aa1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W DET1Q99288 334 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W ARO7P32178 256 aa1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W TMA19P35691 167 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W YMR144WP40214 342 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W YJR012CP47087 207 aa1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W HHO1P53551 258 aa1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W CDC14Q00684 551 aa1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W COF1Q03048 143 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W STE23Q06010 1027 aa1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W HRD1Q08109 551 aa1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W UIP4Q08926 304 aa1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W RFM1Q12192 310 aa1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W FRE8Q12209 686 aa1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W PRR2Q12310 699 aa1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W RDI1Q12434 202 aa1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W YCL001W-BQ96VH2 84 aa1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W MSB2P32334 1306 aa1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W CYC3P06182 269 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W SEC4P07560 215 aaKnown RBP1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W YBR242WP38331 238 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W NVJ1P38881 321 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W YER134CP40081 178 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W SWM2P40342 146 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W NAS2P40555 220 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W SBH2P52871 88 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W NIF3P53081 288 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W HHT1P61830 136 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W AIM11P87275 137 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W UBC7Q02159 165 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W YDR391CQ04170 232 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W SEI1Q06058 285 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W HEM25Q07534 307 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W SYC1Q08553 188 aaPredicted RBP1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W PST2Q12335 198 aaKnown RBP1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W RNH203Q12338 110 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W RPN6Q12377 434 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W OCA6Q12454 224 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W YAL063C-AQ3E791 96 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W RPL28P02406 149 aaKnown RBP1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W POX1P13711 748 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W APA2P22108 325 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W ERV1P27882 189 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W YKL075CP36083 450 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W MRPL11P36521 249 aaPredicted RBP1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W IML3P38265 245 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W DLS1P40366 167 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W GON7P46984 123 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W DSK2P48510 373 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W MIG2P53035 382 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W HNT1Q04344 158 aaKnown RBP1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W COX20Q04935 205 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W TAZ1Q06510 381 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W YPR147CQ06522 304 aaKnown RBP1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W FCY2P17064 533 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W YMR31P19955 123 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W STP22P25604 385 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W MRPL15P36523 253 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W FAD1P38913 306 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W RPL13BP40212 199 aaKnown RBP1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W SYS1P41544 203 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W PHB2P50085 310 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W MMS2P53152 137 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W SWT21P53873 357 aaPredicted RBP1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W DIG2Q03373 323 aaKnown RBP1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W YMR244WQ04018 355 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W YMR321CQ04898 105 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W CTR3Q06686 241 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W YDL211CQ12121 372 aa1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP1.03□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W YPS1P32329 569 aa1.03□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W PTC1P35182 281 aa1.03□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W YKR041WP36134 250 aa1.03□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W YCR087C-AP37263 153 aa1.03□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W DOG1P38774 246 aa1.03□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W YHR127WP38833 243 aaKnown RBP1.03□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data1.03□□□□□ -2.25not detected
MDS3YGL197W LSM8P47093 109 aaKnown RBP1.03□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W YGL034CP53186 121 aa1.03□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W CPD1P53314 239 aa1.03□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W DPP1Q05521 289 aa1.03□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W YPL264CQ08980 353 aa1.03□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W TAF10Q12030 206 aa1.03□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W YOR012WQ12351 137 aa1.03□□□□□ -2.25
MDS3YGL197W YIR021W-AQ3E739 70 aa1.03□□□□□ -2.25
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