RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585236.5

TSPOAP1-AS1-211, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 1,791 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KIF12Q96FN5 646 aa28.17■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KRT12Q99456 494 aa28.17■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 C11orf70Q9BRQ4 267 aa28.17■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 SNTG2Q9NY99 539 aa28.17■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 ADAM22Q9P0K1 906 aa28.17■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 STIM2Q9P246 746 aa28.17■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 L1RE1Q9UN81 338 aa28.17■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 DERAQ9Y315 318 aa28.17■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 SPDYE4A6NLX3 237 aa28.16■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 RBP5P82980 135 aa28.16■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 MAP9Q49MG5 647 aa28.16■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 SNX27Q96L92 541 aa28.16■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 ANAPC7Q9UJX3 599 aa28.16■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 PCDHGC3Q9UN70 934 aa28.16■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 AGAP1Q9UPQ3 857 aa28.16■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CCDC188H7C350 402 aa28.16■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 SASH3O75995 380 aa28.16■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 STAU1O95793 577 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 P4HA1P13674 534 aa28.16■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 RAP1GAPP47736 663 aa28.16■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 SLC7A5Q01650 507 aa28.16■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 PTP4A2Q12974 167 aa28.16■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KRT35Q92764 455 aa28.16■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 HPDLQ96IR7 371 aa28.16■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 SDCBP2Q9H190 292 aa28.16■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CYP3A43Q9HB55 503 aa28.16■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 SPOPO43791 374 aa28.15■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CTNNA2P26232 953 aa28.15■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 GUCY2FP51841 1108 aa28.15■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 YARSP54577 528 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 PRKCZQ05513 592 aa28.15■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CLUL1Q15846 466 aa28.15■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 C2CD6Q53TS8 623 aa28.15■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 TAF2Q6P1X5 1199 aa28.15■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa28.15■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 TFAP2BQ92481 460 aa28.15■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CFHR5Q9BXR6 569 aa28.15■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 SMYD3Q9H7B4 428 aa28.15■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CCDC66A2RUB6 948 aa28.14■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KRIT1O00522 736 aa28.14■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 SEPT4O43236 478 aa28.14■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 FGGP02679 453 aa28.14■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 PEX5P50542 639 aa28.14■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa28.14■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 SPC25Q9HBM1 224 aa28.14■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 PAEPP09466 180 aa28.14■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 MMP8P22894 467 aa28.14■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 MARCKSL1P49006 195 aa28.14■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CDH8P55286 799 aa28.14■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 NKX3-2P78367 333 aa28.14■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa28.14■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 HDXQ7Z353 690 aa28.14■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 TMEM35BQ8NCS4 154 aa28.14■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 AP1M1Q9BXS5 423 aa28.14■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa28.13■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa28.13■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 LLGL2Q6P1M3 1020 aa28.13■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa28.13■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KLHL7Q8IXQ5 586 aa28.13■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa28.13■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 SCINQ9Y6U3 715 aa28.13■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 MAP2K7O14733 419 aa28.12■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CILPO75339 1184 aa28.12■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 PGK1P00558 417 aa28.12■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 RARBP10826 455 aa28.12■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 TNFRSF8P28908 595 aa28.12■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 RAD23BP54727 409 aa28.12■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CXCL17Q6UXB2 119 aa28.12■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CPNE8Q86YQ8 564 aa28.12■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 WHAMMQ8TF30 809 aa28.12■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 MYO1FO00160 1098 aa28.11■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 MED7O43513 233 aa28.11■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CALB1P05937 261 aa28.11■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 MYBL2P10244 700 aa28.11■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 SLC1A1P43005 524 aa28.11■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 TRIM32Q13049 653 aa28.11■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 MAMLD1Q13495 774 aa28.11■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 ZBTB6Q15916 424 aa28.11■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KRT222Q8N1A0 295 aa28.11■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 TRIM7Q9C029 511 aa28.11■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CXCL16Q9H2A7 254 aa28.11■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa28.11■■■□□ 2.09
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 HES2Q9Y543 173 aa28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms