RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561431.1

LRRC28-222, Transcript of leucine rich repeat containing 28, human

TSL 3

Gene LRRC28, Length 754 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRRC28-222	ENST00000561431	ADCY6	O43306	1168 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	MTSS1	O43312	755 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	PLIN1	O60240	522 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	CR2	P20023	1033 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	EDNRB	P24530	442 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	APBA1	Q02410	837 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	CREM	Q03060	361 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	RIN1	Q13671	783 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	SEPT2	Q15019	361 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	ATP2B3	Q16720	1220 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	ZNF280D	Q6N043	979 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431		Q6ZVL8	140 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	DGKH	Q86XP1	1220 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	DENND1C	Q8IV53	801 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431		Q8N1X5	172 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	REPS2	Q8NFH8	660 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	RABGGTA	Q92696	567 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	RGMA	Q96B86	450 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	C8orf49	Q96NF6	230 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	TAAR9	Q96RI9	348 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	TCF25	Q9BQ70	676 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	USP19	O94966	1318 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LRRC28-222	ENST00000561431	CCDC189	A1A4V9	331 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	CFAP69	A5D8W1	941 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	LAMTOR5	O43504	91 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	GPR32	O75388	356 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	RAP2A	P10114	183 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	IL2RB	P14784	551 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	TACR2	P21452	398 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	SREBF1	P36956	1147 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	GNAL	P38405	381 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	GDF5	P43026	501 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	GZMK	P49863	264 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	FAM193A	P78312	1265 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	CDC42EP1	Q00587	391 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	HGFAC	Q04756	655 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	NFYC	Q13952	458 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	UBE4A	Q14139	1066 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	DAAM2	Q86T65	1068 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	C3orf20	Q8ND61	904 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	IL17RA	Q96F46	866 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	SAMD11	Q96NU1	681 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	TESK2	Q96S53	571 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	GPHA2	Q96T91	129 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	POLH	Q9Y253	713 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	EVC2	Q86UK5	1308 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	MYOM1	P52179	1685 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	NFAT5	O94916	1531 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431		H3BUI4	141 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	TEX33	O43247	280 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	SGTA	O43765	313 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	MYL1	P05976	194 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	DDC	P20711	480 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	MAN1A1	P33908	653 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	PTH1R	Q03431	593 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	GRM3	Q14832	879 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	RAB39A	Q14964	217 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	LLGL1	Q15334	1064 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	PRR18	Q8N4B5	295 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	TIFA	Q96CG3	184 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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