RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555569.1

PCNX4-209, Transcript of pecanex 4, humanhuman

TSL 3

Gene PCNX4, Length 515 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4-209ENST00000555569 DHX58Q96C10 678 aa14.94□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 TCEAL4Q96EI5 215 aa14.94□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 SAAL1Q96ER3 474 aa14.94□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 PGLYRP2Q96PD5 576 aa14.94□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 KXD1Q9BQD3 176 aa14.94□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 TBC1D17Q9HA65 648 aa14.94□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 ARHGEF3Q9NR81 526 aa14.94□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 KBTBD4Q9NVX7 518 aa14.94□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 CEP72Q9P209 647 aa14.94□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 YIPF1Q9Y548 306 aa14.94□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 MICAL2O94851 1124 aa14.93□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 CYP11A1P05108 521 aa14.93□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 TAF6P49848 677 aa14.93□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 AMPD3Q01432 767 aa14.93□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 CYP4A22Q5TCH4 519 aa14.93□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa14.93□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 ARMCX5Q6P1M9 558 aa14.93□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa14.93□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 BRSK2Q8IWQ3 736 aa14.93□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 HS6ST3Q8IZP7 471 aa14.93□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 IQUBQ8NA54 791 aa14.93□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 LEMD2Q8NC56 503 aa14.93□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa14.93□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 KCNG4Q8TDN1 519 aa14.93□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 TMEM209Q96SK2 561 aa14.93□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 CBWD1Q9BRT8 395 aa14.93□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 TRIM9Q9C026 710 aa14.93□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 TMEM206Q9H813 350 aa14.93□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 DSEQ9UL01 958 aa14.93□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 MIA3Q5JRA6 1907 aa14.93□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 MTMR11A4FU01 709 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 GOLGA8IPA6NC78 632 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 GOLGA8JA6NMD2 632 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 CYB561D2O14569 222 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 ECI2O75521 394 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 CCR2P41597 374 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 EPHA5P54756 1037 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 ASIC1P78348 528 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 DUSP4Q13115 394 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 PLD1Q13393 1074 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 ATL3Q6DD88 541 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 METTL23Q86XA0 190 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 CCDC105Q8IYK2 499 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 DTWD2Q8NBA8 298 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 ZNF560Q96MR9 790 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 CRISPLD1Q9H336 500 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 PCIF1Q9H4Z3 704 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 ASAH2Q9NR71 780 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 EXTL3O43909 919 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 MOSPD3O75425 235 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 MYL4P12829 197 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 ALDH1A3P47895 512 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 EPHB3P54753 998 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 WNT7BP56706 349 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 PFKPQ01813 784 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 SV2CQ496J9 727 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 TANGO2Q6ICL3 276 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 CENPPQ6IPU0 288 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 CNNM4Q6P4Q7 775 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 ATAD1Q8NBU5 361 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 GLIS3Q8NEA6 775 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 OR10T2Q8NGX3 314 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 HPS3Q969F9 1004 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 ELSPBP1Q96BH3 223 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 SHDQ96IW2 340 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 PCDHA7Q9UN72 937 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 KPNA7A9QM74 516 aa14.9□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 PNPLA4P41247 253 aa14.9□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 ME1P48163 572 aa14.9□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 STARD6P59095 220 aa14.9□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 PKP1Q13835 747 aa14.9□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 SLC39A12Q504Y0 691 aa14.9□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 SLC44A4Q53GD3 710 aa14.9□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 FAM78AQ5JUQ0 283 aa14.9□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 WSCD1Q658N2 575 aa14.9□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 THEM5Q8N1Q8 247 aa14.9□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 GPD1LQ8N335 351 aa14.9□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 C1orf127Q8N9H9 656 aa14.9□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 BORCS6Q96GS4 357 aa14.9□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 ASB16Q96NS5 453 aa14.9□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 C7orf25Q9BPX7 421 aa14.9□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa14.9□□□□□ -0.02
PCNX4-209ENST00000555569 DNAJC25Q9H1X3 360 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms