RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	15.1	■□□□□ 0.01
CS-231	ENST00000552222	PLIN2	Q99541	437 aa		15.1	■□□□□ 0.01
CS-231	ENST00000552222	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	15.1	■□□□□ 0.01
CS-231	ENST00000552222	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		15.1	■□□□□ 0.01
CS-231	ENST00000552222		A0A087X0B3	334 aa		15.09	■□□□□ 0.01
CS-231	ENST00000552222	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		15.09	■□□□□ 0.01
CS-231	ENST00000552222	POU2F2	P09086	479 aa		15.09	■□□□□ 0.01
CS-231	ENST00000552222	GLRA2	P23416	452 aa		15.09	■□□□□ 0.01
CS-231	ENST00000552222	MPL	P40238	635 aa		15.09	■□□□□ 0.01
CS-231	ENST00000552222	CLCNKB	P51801	687 aa		15.09	■□□□□ 0.01
CS-231	ENST00000552222	RESP18	Q5W5W9	173 aa		15.09	■□□□□ 0.01
CS-231	ENST00000552222	SMARCD2	Q92925	531 aa		15.09	■□□□□ 0.01
CS-231	ENST00000552222	MTR	Q99707	1265 aa		15.09	■□□□□ 0.01
CS-231	ENST00000552222	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		15.09	■□□□□ 0.01
CS-231	ENST00000552222	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		15.09	■□□□□ 0.01
CS-231	ENST00000552222	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		15.09	■□□□□ 0.01
CS-231	ENST00000552222	CEP72	Q9P209	647 aa		15.09	■□□□□ 0.01
CS-231	ENST00000552222	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		15.09	■□□□□ 0.01
CS-231	ENST00000552222	INVS	Q9Y283	1065 aa		15.09	■□□□□ 0.01
CS-231	ENST00000552222	GDA	Q9Y2T3	454 aa		15.09	■□□□□ 0.01
CS-231	ENST00000552222	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		15.09	■□□□□ 0.01
CS-231	ENST00000552222		A0A1B0GUA9	196 aa		15.08	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	PRRG1	O14668	218 aa		15.08	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	15.08	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	15.08	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	DGAT1	O75907	488 aa		15.08	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	RECQL4	O94761	1208 aa		15.08	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	LRG1	P02750	347 aa		15.08	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	CMA1	P23946	247 aa		15.08	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	AXL	P30530	894 aa		15.08	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	CNR2	P34972	360 aa		15.08	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	CDR1	P51861	262 aa		15.08	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	15.08	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	TNK2	Q07912	1038 aa		15.08	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		15.08	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		15.08	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	15.08	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		15.08	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		15.08	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	GAB3	Q8WWW8	586 aa		15.08	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	15.08	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	EDEM2	Q9BV94	578 aa		15.08	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		15.08	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	STK17A	Q9UEE5	414 aa		15.08	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	15.08	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222		A0A1W2PQ27	194 aa		15.07	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222		A0A1W2PQ64	194 aa		15.07	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222		A0A1W2PQD8	194 aa		15.07	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		15.07	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	PATE3	B3GLJ2	98 aa		15.07	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		15.07	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	15.07	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	B3GAT3	O94766	335 aa		15.07	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	PLA2G4B	P0C869	781 aa		15.07	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	CCDC192	P0DO97	292 aa		15.07	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	LIG1	P18858	919 aa		15.07	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	CYP11B2	P19099	503 aa		15.07	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	SLC12A3	P55017	1021 aa		15.07	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	15.07	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	15.07	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		15.07	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	PADI6	Q6TGC4	694 aa		15.07	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		15.07	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	15.07	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	15.07	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	RAD54L	Q92698	747 aa		15.07	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	CCDC51	Q96ER9	411 aa		15.07	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	PANK2	Q9BZ23	570 aa		15.07	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		15.07	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	KLK13	Q9UKR3	277 aa		15.07	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		15.06	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		15.06	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	15.06	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	TH	P07101	528 aa		15.06	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	CTH	P32929	405 aa		15.06	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	ARL2	P36404	184 aa		15.06	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	E2F4	Q16254	413 aa		15.06	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	15.06	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		15.06	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		15.06	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		15.06	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	PDILT	Q8N807	584 aa		15.06	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		15.06	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		15.06	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		15.06	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	TCP11	Q8WWU5	503 aa		15.06	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	15.06	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	IER2	Q9BTL4	223 aa		15.06	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		15.06	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	POLD4	Q9HCU8	107 aa		15.06	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		15.06	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	15.06	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	HPSE	Q9Y251	543 aa		15.06	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		15.06	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		15.06	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	15.06	■□□□□ 0
CS-231	ENST00000552222	ASAP2	O43150	1006 aa		15.05	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	ABLIM3	O94929	683 aa		15.05	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	STAT6	P42226	847 aa		15.05	■□□□□ -0
CS-231	ENST00000552222	CREB5	Q02930	508 aa		15.05	■□□□□ -0

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