RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa15□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 TTC9BQ8N6N2 239 aa15□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 BEST2Q8NFU1 509 aa15□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 RIN3Q8TB24 985 aa15□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 BPIFB1Q8TDL5 484 aa15□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 DDX12PQ92771 950 aa15□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 TPSD1Q9BZJ3 242 aa15□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 POLD4Q9HCU8 107 aa15□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 MAST4O15021 2626 aa15□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 DPYSL4O14531 572 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 ATG13O75143 517 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 CPB1P15086 417 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 MAPK8P45983 427 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 OSTNP61366 133 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP14.99□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 DUSP4Q13115 394 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 MAPK6Q16659 721 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 ZNF280DQ6N043 979 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 HAUS6Q7Z4H7 955 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 ADAM32Q8TC27 787 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 OXER1Q8TDS5 423 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 SUSD3Q96L08 255 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 FAM83CQ9BQN1 747 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 ADPGKQ9BRR6 497 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 ATXN3LQ9H3M9 355 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 EBF3Q9H4W6 596 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 FSCN3Q9NQT6 498 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 GKN1Q9NS71 199 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 GJB4Q9NTQ9 266 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 FAM221BA6H8Z2 402 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 MARCH6O60337 910 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 GALK1P51570 392 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 CDR1P51861 262 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 SCAPQ12770 1279 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 DMC1Q14565 340 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 PIP4P1Q86T03 277 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 TBC1D32Q96NH3 1257 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 AGXT2Q9BYV1 514 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 OBP2AQ9NY56 170 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 EBF1Q9UH73 591 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 CCL26Q9Y258 94 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 NUB1Q9Y5A7 615 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 APBB3O95704 486 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 ARSAP15289 507 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 GABRR2P28476 465 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 MCM2P49736 904 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 DGKEP52429 567 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 PLCB2Q00722 1185 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 RUNX3Q13761 415 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 KRT32Q14532 448 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 KARSQ15046 597 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 CYP2U1Q7Z449 544 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 PIGKQ92643 395 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 TMEM74BQ9NUR3 256 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 CITO14578 2027 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 DENND4CQ5VZ89 1909 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 WNT7AO00755 349 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 DEXIO95424 95 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 SEC24BO95487 1268 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 ATP2B1P20020 1258 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 MCM4P33991 863 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 ATF7IP2Q5U623 682 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 TENM4Q6N022 2769 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 SYT13Q7L8C5 426 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 FRMD1Q8N878 549 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 ATAD1Q8NBU5 361 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 SLC46A2Q9BY10 475 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 C2orf40Q9H1Z8 148 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 CDT1Q9H211 546 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 IL21Q9HBE4 155 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 MAFFQ9ULX9 164 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 PCDHB8Q9UN66 801 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-230ENST00000551968 RPS6KB1P23443 525 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 GRM5P41594 1212 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 EPHB3P54753 998 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 SEMA3BQ13214 749 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 TRIM61Q5EBN2 209 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 CENPPQ6IPU0 288 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 GALNT17Q6IS24 598 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-230ENST00000551968 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms