RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550159.5

CS-218, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-218ENST00000550159 RFX1P22670 979 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 CA8P35219 290 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 GCLMP48507 274 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 CASP4P49662 377 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 TAF6P49848 677 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 ADAM15Q13444 863 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 NCOA4Q13772 614 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP10.35□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 EXOC3L4Q17RC7 722 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 ZNF699Q32M78 642 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 ZNF667Q5HYK9 610 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 GLRA4Q5JXX5 417 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 THEM5Q8N1Q8 247 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 LRRC52Q8N7C0 313 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 CEP120Q8N960 986 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 ZFP42Q96MM3 310 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 NT5C1BQ96P26 610 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 FUCA2Q9BTY2 467 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 PLVAPQ9BX97 442 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 MTMR12Q9C0I1 747 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 VPS16Q9H269 839 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 NDST4Q9H3R1 872 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 TBC1D13Q9NVG8 400 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 SPG21Q9NZD8 308 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 AGAP1Q9UPQ3 857 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 CITO14578 2027 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 PODXLO00592 558 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 GRM6O15303 877 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 INPPL1O15357 1258 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 ITGB3P05106 788 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 EDN1P05305 212 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 RB1P06400 928 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 CTNNB1P35222 781 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 FMO5P49326 533 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 PTPN21Q16825 1174 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 CLLU1OSQ5K130 101 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 ALKAL1Q6UXT8 129 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 TRIM59Q8IWR1 403 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 TMEM105Q8N8V8 129 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 NEK11Q8NG66 645 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 LINC01599Q8WXQ3 324 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 HPDLQ96IR7 371 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 FAXDC2Q96IV6 333 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 MSLNLQ96KJ4 702 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 CASD1Q96PB1 797 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 MMS19Q96T76 1030 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 NUP58Q9BVL2 599 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 LMAN2LQ9H0V9 348 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 RNF39Q9H2S5 420 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 RAB20Q9NX57 234 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 TAB2Q9NYJ8 693 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 GCNT4Q9P109 453 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP10.34□□□□□ -0.756e-6■□□□□ 9.1
CS-218ENST00000550159 TTC3P53804 2025 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 MICAL3Q7RTP6 2002 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-218ENST00000550159 FRYLO94915 3013 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-218ENST00000550159 FSD2A1L4K1 749 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-218ENST00000550159 CASTOR2A6NHX0 329 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-218ENST00000550159 H7C4K7 107 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-218ENST00000550159 PMM2O15305 246 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-218ENST00000550159 FAM189A1O60320 539 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-218ENST00000550159 ADRB2P07550 413 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-218ENST00000550159 NFICP08651 508 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-218ENST00000550159 TRIM49P0CI25 452 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-218ENST00000550159 TRIM49CP0CI26 452 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-218ENST00000550159 LRPAP1P30533 357 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-218ENST00000550159 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
CS-218ENST00000550159 COPB1P53618 953 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
CS-218ENST00000550159 MFAP3P55082 362 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-218ENST00000550159 BCAR1P56945 870 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-218ENST00000550159 CLDN10P78369 228 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-218ENST00000550159 FANCCQ00597 558 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-218ENST00000550159 UBE3AQ05086 875 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-218ENST00000550159 TRIM14Q14142 442 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-218ENST00000550159 IQCB1Q15051 598 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-218ENST00000550159 KRT31Q15323 416 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-218ENST00000550159 XKR4Q5GH76 650 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-218ENST00000550159 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-218ENST00000550159 CDKAL1Q5VV42 579 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-218ENST00000550159 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
CS-218ENST00000550159 KCNT2Q6UVM3 1135 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-218ENST00000550159 PPFIBP1Q86W92 1011 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-218ENST00000550159 KIAA2013Q8IYS2 634 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-218ENST00000550159 SMRP1Q8NCR6 262 aa10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms