RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540101.2

C16orf62-211, Transcript of UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

TSL 3

Gene C16orf62, Length 461 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62-211ENST00000540101 TATDN2Q93075 761 aa8.4□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 JAKMIP2Q96AA8 810 aa8.4□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 YME1L1Q96TA2 773 aa8.4□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 RAD9AQ99638 391 aa8.4□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 EDEM3Q9BZQ6 932 aa8.4□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 SDCBP2Q9H190 292 aa8.4□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 CERS4Q9HA82 394 aa8.4□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 CEP72Q9P209 647 aa8.4□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 POLIQ9UNA4 740 aa8.4□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa8.4□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 INSL6Q9Y581 213 aa8.4□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 NME7Q9Y5B8 376 aa8.4□□□□□ -1.06
C16orf62-211ENST00000540101 MICAL3Q7RTP6 2002 aa8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 LINC01553A4QN01 128 aa8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 KPNA7A9QM74 516 aa8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 F8VZ95 297 aa8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 NRP1O14786 923 aa8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 PHACTR2O75167 634 aa8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 B3GAT3O94766 335 aa8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 KRT19P08727 400 aa8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 FECHP22830 423 aa8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 PAX3P23760 479 aa8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF132P52740 706 aa8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 BCAR1P56945 870 aa8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 TFF2Q03403 129 aa8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 TAP1Q03518 808 aa8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 INCA1Q0VD86 236 aa8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 LRMPQ12912 555 aa8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 TRPC3Q13507 836 aa8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 WDR72Q3MJ13 1102 aa8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 SV2CQ496J9 727 aa8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 TIGD5Q53EQ6 642 aa8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 TMC6Q7Z403 805 aa8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 SPRED2Q7Z698 418 aa8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 SLC39A11Q8N1S5 342 aa8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 WHAMMQ8TF30 809 aa8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 IQCDQ96DY2 449 aa8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 SUSD3Q96L08 255 aa8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF560Q96MR9 790 aa8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 NT5C1BQ96P26 610 aa8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 DNAJC7Q99615 494 aa8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 SMYD3Q9H7B4 428 aa8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 DNAJC12Q9UKB3 198 aa8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 CAPN11Q9UMQ6 739 aa8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 L1RE1Q9UN81 338 aa8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 C5orf67F2Z3F1 127 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 GABRDO14764 452 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 MFAP3LO75121 409 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 CILPO75339 1184 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 TACC1O75410 805 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 CYP11A1P05108 521 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 FAM163BP0C2L3 166 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 LAG3P18627 525 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 CASP14P31944 242 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 BRCC3P46736 316 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 OR1G1P47890 313 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 MYO1EQ12965 1108 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 TRIM14Q14142 442 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF667Q5HYK9 610 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 WDR44Q5JSH3 913 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 KCNT2Q6UVM3 1135 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 RRAGAQ7L523 313 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 DPH6Q7L8W6 267 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 FAM71AQ8IYT1 594 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 PPM1KQ8N3J5 372 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 PDCL2Q8N4E4 241 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 TOP6BLQ8N6T0 577 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 TC2NQ8N9U0 490 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 NEK11Q8NG66 645 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 HASPINQ8TF76 798 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 ARNTL2Q8WYA1 636 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 IGSF21Q96ID5 467 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 SENP8Q96LD8 212 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 TWNKQ96RR1 684 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 PPP1R9BQ96SB3 815 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 RTP3Q9BQQ7 232 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 SYT11Q9BT88 431 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 NUP58Q9BVL2 599 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 STK33Q9BYT3 514 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 GPR62Q9BZJ7 368 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 IMPG2Q9BZV3 1241 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 CYP3A43Q9HB55 503 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 IMPACTQ9P2X3 320 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 HMGXB4Q9UGU5 601 aa8.38□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 ADAM28Q9UKQ2 775 aa8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms