RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 SLIT2O94813 1529 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 PMS2P1A4D2B8 440 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 ULK1O75385 1050 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 PF4V1P10720 104 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 MAN2A1Q16706 1144 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 CCDC93Q567U6 631 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 CLEC14AQ86T13 490 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 CLIP3Q96DZ5 547 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 ANO3Q9BYT9 981 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 ANLNQ9NQW6 1124 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 MYRFQ9Y2G1 1151 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 GLI3P10071 1580 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 RGS12O14924 1447 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 TOX4O94842 621 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 FSBPO95073 299 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 ACO1P21399 889 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 CCND1P24385 295 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 RENBPP51606 427 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 FOXL1Q12952 345 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 GALEQ14376 348 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 CDSNQ15517 529 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 GGNQ86UU5 652 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 RASSF3Q86WH2 238 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 ARHGAP45Q92619 1136 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 GJA10Q969M2 543 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 SKA1Q96BD8 255 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 FAM89AQ96GI7 184 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 MPP4Q96JB8 637 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 LRGUKQ96M69 825 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 UIMC1Q96RL1 719 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 MAN1C1Q9NR34 630 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 PHTF1Q9UMS5 762 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 DMTF1Q9Y222 760 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 UBR2Q8IWV8 1755 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 PRSS38A1L453 326 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 PRSS47A8MTI9 375 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 PMM2O15305 246 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 PFKMP08237 780 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 XPAP23025 273 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 HHEXQ03014 270 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 GBX1Q14549 363 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 GAGE13Q4V321 117 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 RINLQ6ZS11 566 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 GAB3Q8WWW8 586 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 OSBPL6Q9BZF3 934 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 SMC4Q9NTJ3 1288 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 TSPYL4Q9UJ04 414 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 PAPPAQ13219 1627 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 ITGB4P16144 1822 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 KIF16BQ96L93 1317 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 KCNQ3O43525 872 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 CLEC2LP0C7M8 214 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 VSIG10L2P0DP72 767 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 MYBL2P10244 700 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 IL2RBP14784 551 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 MANFP55145 182 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 SESN3P58005 492 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 PPARAQ07869 468 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 BIRC3Q13489 604 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 TOMM20Q15388 145 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 C1orf141Q5JVX7 400 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 SPDYAQ5MJ70 313 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 CCDC62Q6P9F0 684 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 GAREM2Q75VX8 874 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 SRLQ86TD4 932 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 D2HGDHQ8N465 521 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 EDAQ92838 391 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 GPHA2Q96T91 129 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 SOX7Q9BT81 388 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 NLRC4Q9NPP4 1024 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 NCDNQ9UBB6 729 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 HDAC9Q9UKV0 1011 aa4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms