RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519760.1

CDK1-208, Transcript of cyclin dependent kinase 1, human

TSL 3

Gene CDK1, Length 276 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDK1-208	ENST00000519760	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	KAZN	Q674X7	775 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	FBXL20	Q96IG2	436 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	TMX1	Q9H3N1	280 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	INTS13	Q9NVM9	706 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	PROM1	O43490	865 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	LMO1	P25800	156 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	CCDC93	Q567U6	631 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	TRIB1	Q96RU8	372 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF785	A8K8V0	405 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	MPPED1	O15442	326 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	VPS4B	O75351	444 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	GJB1	P08034	283 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	RHO	P08100	348 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	CHRM3	P20309	590 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	GRIA3	P42263	894 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	PROK1	P58294	105 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	KRT85	P78386	507 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	TXNRD1	Q16881	649 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	TTC7B	Q86TV6	843 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	POC1B	Q8TC44	478 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	SNX19	Q92543	992 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	BRD9	Q9H8M2	597 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	LINC00473	A8K010	186 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	KIF20A	O95235	890 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	C1R	P00736	705 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	PDC	P20941	246 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	CCND1	P24385	295 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	PRDX5	P30044	214 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	NPTX2	P47972	431 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	NHLH1	Q02575	133 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	PTPRR	Q15256	657 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	SMO	Q99835	787 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	ETAA1	Q9NY74	926 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	DKK3	Q9UBP4	350 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	WDR27	A2RRH5	827 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760		F5H697	171 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	AHSG	P02765	367 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	PDHA1	P08559	390 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	ITPKB	P27987	946 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	SMARCA1	P28370	1054 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	PIGF	Q07326	219 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	FOXF2	Q12947	444 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	MIER2	Q8N344	545 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	C3orf20	Q8ND61	904 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	NELL1	Q92832	810 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	SCAMP4	Q969E2	229 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	PGBD1	Q96JS3	809 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	UROC1	Q96N76	676 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	KAT6A	Q92794	2004 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CDK1-208	ENST00000519760	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79

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