RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515835.2

PDE4D-225, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PDE4D, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-225ENST00000515835 CCDC191Q8NCU4 936 aa7.6□□□□□ -1.19
PDE4D-225ENST00000515835 CEP89Q96ST8 783 aa7.6□□□□□ -1.19
PDE4D-225ENST00000515835 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
PDE4D-225ENST00000515835 ING3Q9NXR8 418 aa7.6□□□□□ -1.19
PDE4D-225ENST00000515835 MRFAP1Q9Y605 127 aa7.6□□□□□ -1.19
PDE4D-225ENST00000515835 NUP98P52948 1817 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-225ENST00000515835 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-225ENST00000515835 IL16Q14005 1332 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-225ENST00000515835 KLHL33A6NCF5 533 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-225ENST00000515835 RAD17O75943 681 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-225ENST00000515835 CTSSP25774 331 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-225ENST00000515835 MALLQ13021 153 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-225ENST00000515835 TNIP1Q15025 636 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-225ENST00000515835 ACAP1Q15027 740 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-225ENST00000515835 FAM180AQ6UWF9 173 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-225ENST00000515835 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-225ENST00000515835 CMTM4Q8IZR5 234 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-225ENST00000515835 CNTROBQ8N137 903 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-225ENST00000515835 DNERQ8NFT8 737 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-225ENST00000515835 SNX33Q8WV41 574 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-225ENST00000515835 FAM89AQ96GI7 184 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-225ENST00000515835 SAMD11Q96NU1 681 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-225ENST00000515835 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-225ENST00000515835 GREM2Q9H772 168 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-225ENST00000515835 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-225ENST00000515835 SCOCQ9UIL1 159 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-225ENST00000515835 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-225ENST00000515835 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-225ENST00000515835 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-225ENST00000515835 SCN4AP35499 1836 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-225ENST00000515835 CNTNAP1P78357 1384 aa7.59□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 RPTORQ8N122 1335 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 A0A1W2PRX2 142 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 PATE3B3GLJ2 98 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 K7ESM1 405 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 PRAMEF4O60810 478 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 PHF2O75151 1096 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 CCT2P78371 535 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 CXCL9Q07325 125 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP7.58□□□□□ -1.26e-7■■■■■ 29.4
PDE4D-225ENST00000515835 PTPN21Q16825 1174 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 C8orf58Q8NAV2 365 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 JADE3Q92613 823 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 IL23AQ9NPF7 189 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 GPRC5DQ9NZD1 345 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 RCAN3Q9UKA8 241 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 COL4A5P29400 1685 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 FOXS1O43638 330 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 PCDHGA12O60330 932 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 EPS15P42566 896 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 RPS8P62241 208 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 ACAP2Q15057 778 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 ABHD15Q6UXT9 468 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 TTC9BQ8N6N2 239 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 GPR156Q8NFN8 814 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 DPF2Q92785 391 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 CHMP4CQ96CF2 233 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 OR14A2Q96R54 314 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 EYA3Q99504 573 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 STK31Q9BXU1 1019 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 PGAP2Q9UHJ9 254 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 UBE2QL1A1L167 161 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 ANP32CO43423 234 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 XPOTO43592 962 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 CCND1P24385 295 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 RPS12P25398 132 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 MCAMP43121 646 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 NEK2P51955 445 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 NPEPPSP55786 919 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 DUSP2Q05923 314 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 NEXNQ0ZGT2 675 aa7.56□□□□□ -1.2
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PDE4D-225ENST00000515835 DEFB115Q30KQ5 88 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 CCDC152Q4G0S7 254 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 KSR2Q6VAB6 950 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 POLNQ7Z5Q5 900 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 WDR63Q8IWG1 891 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 FUKQ8N0W3 1084 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 MYD88Q99836 296 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 TCF25Q9BQ70 676 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 ADI1Q9BV57 179 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 TLR9Q9NR96 1032 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 PI4KAP2A4QPH2 592 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF623O75123 536 aa7.55□□□□□ -1.2
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