RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 ZPBP2Q6X784 338 aa13.65□□□□□ -0.22
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PRAME-213ENST00000492657 RAPGEF5Q92565 580 aa13.65□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 KCNN1Q92952 543 aa13.65□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
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PRAME-213ENST00000492657 RAP1GAPP47736 663 aa13.63□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 IGBP1P78318 339 aa13.63□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa13.63□□□□□ -0.23
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PRAME-213ENST00000492657 DUOXA2Q1HG44 320 aa13.63□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa13.63□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 HOOK3Q86VS8 718 aa13.63□□□□□ -0.23
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PRAME-213ENST00000492657 TRPC3Q13507 836 aa13.63□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 TMEM132AQ24JP5 1023 aa13.63□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 GPAT2Q6NUI2 795 aa13.63□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 RHBDF2Q6PJF5 856 aa13.63□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa13.63□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 RUNDC3BQ96NL0 473 aa13.63□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 ADAM7Q9H2U9 754 aa13.63□□□□□ -0.23
PRAME-213ENST00000492657 RNPEPQ9H4A4 650 aa13.63□□□□□ -0.23
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