RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464168.5

USP4-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 4

Gene USP4, Length 601 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-208ENST00000464168 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
USP4-208ENST00000464168 PLD1Q13393 1074 aa24.58■■□□□ 1.53
USP4-208ENST00000464168 KYAT1Q16773 422 aa24.58■■□□□ 1.53
USP4-208ENST00000464168 CENPPQ6IPU0 288 aa24.58■■□□□ 1.53
USP4-208ENST00000464168 ATAD1Q8NBU5 361 aa24.58■■□□□ 1.53
USP4-208ENST00000464168 E2F7Q96AV8 911 aa24.58■■□□□ 1.53
USP4-208ENST00000464168 TBX20Q9UMR3 447 aa24.58■■□□□ 1.53
USP4-208ENST00000464168 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa24.58■■□□□ 1.53
USP4-208ENST00000464168 OGTO15294 1046 aa24.57■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 PIGRP01833 764 aa24.57■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 TYMPP19971 482 aa24.57■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 NRLP54845 237 aa24.57■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 LILRA4P59901 499 aa24.57■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 MYBPC2Q14324 1141 aa24.57■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 STXBP5Q5T5C0 1151 aa24.57■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 SPATA1Q5VX52 437 aa24.57■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 OVOS1Q6IE37 1185 aa24.57■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 LRRC15Q8TF66 581 aa24.57■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 TSPAN18Q96SJ8 248 aa24.57■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 REEP2Q9BRK0 252 aa24.57■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 ODF2LQ9ULJ1 636 aa24.57■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 A0A0B4J269 797 aa24.56■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 XPOTO43592 962 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 ALDH1A3P47895 512 aa24.56■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 CCR3P51677 355 aa24.56■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 FCHO2Q0JRZ9 810 aa24.56■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 GAS6Q14393 721 aa24.56■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 GPIHBP1Q8IV16 184 aa24.56■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 TTC9BQ8N6N2 239 aa24.56■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 TMEM209Q96SK2 561 aa24.56■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 MYH11P35749 1972 aa24.56■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa24.55■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 MTMR11A4FU01 709 aa24.55■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 CHADO15335 359 aa24.55■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 ZNF131P52739 623 aa24.55■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 PPP2R5DQ14738 602 aa24.55■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 GAREM2Q75VX8 874 aa24.55■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 GPBP1Q86WP2 473 aa24.55■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 YAF2Q8IY57 180 aa24.55■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 MYCT1Q8N699 235 aa24.55■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa24.55■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 SENP8Q96LD8 212 aa24.55■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 LRRC3BQ96PB8 259 aa24.55■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 MKNK1Q9BUB5 465 aa24.55■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 ASB3Q9Y575 518 aa24.55■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 SLC26A4O43511 780 aa24.54■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 SOAT2O75908 522 aa24.54■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 SDHBP21912 280 aa24.54■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 SCP2P22307 547 aa24.54■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 CXCL12P48061 93 aa24.54■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
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USP4-208ENST00000464168 SLC39A4Q6P5W5 647 aa24.54■■□□□ 1.52
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USP4-208ENST00000464168 MSTO1Q9BUK6 570 aa24.54■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 PARD6AQ9NPB6 346 aa24.54■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa24.54■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
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USP4-208ENST00000464168 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa24.53■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 K7ENM7 598 aa24.53■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 SOX9P48436 509 aa24.53■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 ARHGAP8P85298 464 aa24.53■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 WDR44Q5JSH3 913 aa24.53■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 C9orf57Q5W0N0 161 aa24.53■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 ARMCX5Q6P1M9 558 aa24.53■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 CD302Q8IX05 232 aa24.53■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 MSANTD3Q96H12 275 aa24.53■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 PARVGQ9HBI0 331 aa24.53■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 GMEB2Q9UKD1 530 aa24.53■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 USP18Q9UMW8 372 aa24.53■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 H3BQV1 296 aa24.52■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 PIRO00625 290 aa24.52■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 FAM13AO94988 1023 aa24.52■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 NFICP08651 508 aa24.52■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 ODC1P11926 461 aa24.52■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 PAX3P23760 479 aa24.52■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 GJB2P29033 226 aa24.52■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 UBA7P41226 1012 aa24.52■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 RABEP1Q15276 862 aa24.52■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 LPAL2Q16609 132 aa24.52■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 SPEM1Q8N4L4 309 aa24.52■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 OR10T2Q8NGX3 314 aa24.52■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 CALML4Q96GE6 196 aa24.52■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 TMX3Q96JJ7 454 aa24.52■■□□□ 1.52
USP4-208ENST00000464168 FIZ1Q96SL8 496 aa24.52■■□□□ 1.52
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