RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440825.6

FAAP20-210, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-210ENST00000440825 CDR1P51861 262 aa29.94■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 EHHADHQ08426 723 aa29.94■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 TWF1Q12792 350 aa29.94■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 SV2CQ496J9 727 aa29.94■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa29.94■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 METTL23Q86XA0 190 aa29.94■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 CBWD2Q8IUF1 395 aa29.94■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 FBXL6Q8N531 539 aa29.94■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa29.94■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 RDH13Q8NBN7 331 aa29.94■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 TMEM209Q96SK2 561 aa29.94■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 EXOC1Q9NV70 894 aa29.94■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 CDH7Q9ULB5 785 aa29.94■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 UBE4BO95155 1302 aa29.94■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 PTPN2P17706 415 aa29.93■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 NDUFA8P51970 172 aa29.93■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 ELMOD1Q8N336 334 aa29.93■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 C1orf127Q8N9H9 656 aa29.93■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 FSIP1Q8NA03 581 aa29.93■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 FGF13Q92913 245 aa29.93■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 MTMR12Q9C0I1 747 aa29.93■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa29.93■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 FBXL21Q9UKT6 434 aa29.93■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 TCHHQ07283 1943 aa29.92■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 DOCK8Q8NF50 2099 aa29.92■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 KPNA7A9QM74 516 aa29.92■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 TGFB1I1O43294 461 aa29.92■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 NARSO43776 548 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 BFSP1Q12934 665 aa29.92■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 HS2ST1Q7LGA3 356 aa29.92■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 USP25Q9UHP3 1055 aa29.92■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 DSEQ9UL01 958 aa29.92■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 DUSP12Q9UNI6 340 aa29.92■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 HPSEQ9Y251 543 aa29.92■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 WSCD1Q658N2 575 aa29.91■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa29.91■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 MFSD1Q9H3U5 465 aa29.91■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 NUMBLQ9Y6R0 609 aa29.91■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 TSC2P49815 1807 aa29.91■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 PNPLA4P41247 253 aa29.9■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 DUSP4Q13115 394 aa29.9■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 GPR17Q13304 367 aa29.9■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 MYBPC2Q14324 1141 aa29.9■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 KMT5BQ4FZB7 885 aa29.9■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 IQCEQ6IPM2 695 aa29.9■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 THEM5Q8N1Q8 247 aa29.9■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 SLC44A3Q8N4M1 653 aa29.9■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 OR10T2Q8NGX3 314 aa29.9■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 ITGA11Q9UKX5 1188 aa29.9■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 MAFFQ9ULX9 164 aa29.9■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa29.9■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 YIPF1Q9Y548 306 aa29.9■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 KLRC4O43908 158 aa29.89■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 CYP11A1P05108 521 aa29.89■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 CFHP08603 1231 aa29.89■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 HTR4Q13639 388 aa29.89■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 SLC5A9Q2M3M2 681 aa29.89■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 SCARA3Q6AZY7 606 aa29.89■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 PARM1Q6UWI2 310 aa29.89■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 ATAD1Q8NBU5 361 aa29.89■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 MCRS1Q96EZ8 462 aa29.89■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 KIAA1586Q9HCI6 787 aa29.89■■■□□ 2.38
FAAP20-210ENST00000440825 MTMR11A4FU01 709 aa29.88■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 VNN2O95498 520 aa29.88■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 TNNC2P02585 160 aa29.88■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 DLATP10515 647 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 CEBPBP17676 345 aa29.88■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 SURF1Q15526 300 aa29.88■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 SLC39A12Q504Y0 691 aa29.88■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 NPAS3Q8IXF0 933 aa29.88■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 HS6ST3Q8IZP7 471 aa29.88■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 OR5B17Q8NGF7 314 aa29.88■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 FGF14Q92915 247 aa29.88■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 NXPE3Q969Y0 559 aa29.88■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 BORCS6Q96GS4 357 aa29.88■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 CRISPLD1Q9H336 500 aa29.88■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa29.88■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 INTS13Q9NVM9 706 aa29.88■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 CEP72Q9P209 647 aa29.88■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 PTPRJQ12913 1337 aa29.88■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 MYL4P12829 197 aa29.87■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 ALDH1A3P47895 512 aa29.87■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 VCPP55072 806 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 RBP5P82980 135 aa29.87■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 STK4Q13043 487 aa29.87■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 BMT2Q1RMZ1 405 aa29.87■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 CYP4A22Q5TCH4 519 aa29.87■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 XXYLT1Q8NBI6 393 aa29.87■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 CCDC127Q96BQ5 260 aa29.87■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 TCEAL4Q96EI5 215 aa29.87■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 NOTCH4Q99466 2003 aa29.86■■■□□ 2.37
FAAP20-210ENST00000440825 ANHXE9PGG2 379 aa29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms