RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRPV1Q8NER1 839 aa5.18□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATL2Q8NHH9 583 aa5.18□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 USP6NLQ92738 828 aa5.18□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 EVI5LQ96CN4 794 aa5.18□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 TTC1Q99614 292 aa5.18□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.18□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.18□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 C11orf49Q9H6J7 331 aa5.18□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa5.18□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPTLC3Q9NUV7 552 aa5.18□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 OXSMQ9NWU1 459 aa5.18□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 MCM8Q9UJA3 840 aa5.18□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 NLRC5Q86WI3 1866 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM232C9JQI7 657 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 F5H6K3 240 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 VWA5AO00534 786 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 TGM5O43548 720 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZEB2O60315 1214 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 BRINP1O60477 761 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 TTLL1O95922 423 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 FCER1AP12319 257 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 CPEP16870 476 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC9A1P19634 815 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 VIPR1P32241 457 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 LSSP48449 732 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 STAT2P52630 851 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 NUCB1Q02818 461 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLRC3Q07444 240 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM62Q0P6H9 643 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCTD2Q14681 263 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC9A5Q14940 896 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRRC26Q2I0M4 334 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 BTBD8Q5XKL5 378 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLFN13Q68D06 897 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 MPZL3Q6UWV2 235 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRR23BQ6ZRT6 265 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 EP400NLQ6ZTU2 488 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 NECAB2Q7Z6G3 386 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF605Q86T29 641 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMC5Q8IY18 1101 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 MB21D1Q8N884 522 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 DLG3Q92796 817 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAML3Q96JK9 1138 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 TEX13BQ9BXU2 312 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 IL25Q9H293 177 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNK12Q9HB15 430 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF287Q9HBT7 754 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 MTMR4Q9NYA4 1195 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 STAP2Q9UGK3 403 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 RIPK3Q9Y572 518 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 NUB1Q9Y5A7 615 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 REV3LO60673 3130 aa5.17□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 VCANP13611 3396 aa5.16□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 MICAL3Q7RTP6 2002 aa5.16□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa5.16□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 KBTBD13C9JR72 458 aa5.16□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACOT7O00154 380 aa5.16□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 ABLIM1O14639 778 aa5.16□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPR39O43194 453 aa5.16□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 PGK1P00558 417 aa5.16□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 ALAS1P13196 640 aa5.16□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTGS1P23219 599 aa5.16□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 MCCP23508 829 aa5.16□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC16A2P36021 539 aa5.16□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC1A4P43007 532 aa5.16□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP5.16□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIF11P52732 1056 aa5.16□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa5.16□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMC6Q7Z403 805 aa5.16□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 MIB1Q86YT6 1006 aa5.16□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIM48Q8IWZ4 208 aa5.16□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIAA1958Q8N8K9 716 aa5.16□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 SHCBP1Q8NEM2 672 aa5.16□□□□□ -1.58
RPS3AP54-201ENST00000435535 REPS2Q8NFH8 660 aa5.16□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms