RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429504.6

CERS1-201, Transcript of ceramide synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CERS1, Length 2,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS1-201ENST00000429504 B4GALT4O60513 344 aa29.33■■■□□ 2.29
CERS1-201ENST00000429504 FGFR4P22455 802 aa29.33■■■□□ 2.29
CERS1-201ENST00000429504 CDR1P51861 262 aa29.33■■■□□ 2.29
CERS1-201ENST00000429504 CCNG2Q16589 344 aa29.33■■■□□ 2.29
CERS1-201ENST00000429504 ZNF568Q3ZCX4 644 aa29.33■■■□□ 2.29
CERS1-201ENST00000429504 ATF7IP2Q5U623 682 aa29.33■■■□□ 2.29
CERS1-201ENST00000429504 C3orf20Q8ND61 904 aa29.33■■■□□ 2.29
CERS1-201ENST00000429504 OSBPL8Q9BZF1 889 aa29.33■■■□□ 2.29
CERS1-201ENST00000429504 HBP1O60381 514 aa29.33■■■□□ 2.29
CERS1-201ENST00000429504 OSBPP22059 807 aa29.33■■■□□ 2.29
CERS1-201ENST00000429504 IVDP26440 423 aa29.33■■■□□ 2.29
CERS1-201ENST00000429504 C6orf118Q5T5N4 469 aa29.33■■■□□ 2.29
CERS1-201ENST00000429504 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
CERS1-201ENST00000429504 TMEM35BQ8NCS4 154 aa29.33■■■□□ 2.29
CERS1-201ENST00000429504 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
CERS1-201ENST00000429504 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
CERS1-201ENST00000429504 TMEM191CA6NGB0 347 aa29.32■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 E7EVH7 732 aa29.32■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 TMEM191BP0C7N4 346 aa29.32■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 CD58P19256 250 aa29.32■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 SEC24CP53992 1094 aa29.32■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 CAV1Q03135 178 aa29.32■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 ZNF699Q32M78 642 aa29.32■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 CDCA5Q96FF9 252 aa29.32■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 PCDHGC3Q9UN70 934 aa29.32■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 FAM169AQ9Y6X4 670 aa29.32■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa29.32■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 TRIM66O15016 1216 aa29.32■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 TRAPPC3O43617 180 aa29.32■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 XYLT2Q9H1B5 865 aa29.32■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 ASAP2O43150 1006 aa29.31■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 TNNC2P02585 160 aa29.31■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 TXNP10599 105 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 BRD2P25440 801 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 TMOD1P28289 359 aa29.31■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 ASPAP45381 313 aa29.31■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 MOB2Q70IA6 237 aa29.31■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 C10orf67Q8IYJ2 551 aa29.31■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa29.31■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 NLRP4Q96MN2 994 aa29.31■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 HEMGNQ9BXL5 484 aa29.31■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 AAASQ9NRG9 546 aa29.31■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 USTQ9Y2C2 406 aa29.31■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa29.3■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 TAP1Q03518 808 aa29.3■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 TTLL4Q14679 1199 aa29.3■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa29.3■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 CCDC114Q96M63 670 aa29.3■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 NFKBIZQ9BYH8 718 aa29.3■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 RNF181Q9P0P0 153 aa29.3■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 NEU2Q9Y3R4 380 aa29.3■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa29.3■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 GMNCA6NCL1 334 aa29.3■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 AGTP01019 485 aa29.3■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 CETN2P41208 172 aa29.3■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 MBTD1Q05BQ5 628 aa29.3■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 LRRC38Q5VT99 294 aa29.3■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 EFCAB12Q6NXP0 572 aa29.3■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 THNSL1Q8IYQ7 743 aa29.3■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 COPS5Q92905 334 aa29.3■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 TRAIPQ9BWF2 469 aa29.3■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 TNFSF13BQ9Y275 285 aa29.3■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 GJB6O95452 261 aa29.29■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 ATF2P15336 505 aa29.29■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 GPAT2Q6NUI2 795 aa29.29■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 DNAJC24Q6P3W2 148 aa29.29■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 CCDC25Q86WR0 208 aa29.29■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 CENPTQ96BT3 561 aa29.29■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 OPTNQ96CV9 577 aa29.29■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 RASSF4Q9H2L5 321 aa29.29■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 B4GALT5O43286 388 aa29.29■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 IL18RAPO95256 599 aa29.29■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 SSR1P43307 286 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 MAGEA9P43362 315 aa29.29■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 RCOR2Q8IZ40 523 aa29.29■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 SHCBP1Q8NEM2 672 aa29.29■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 CEP83Q9Y592 693 aa29.29■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 ASB14A6NK59 587 aa29.28■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 GJB1P08034 283 aa29.28■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 WEE2P0C1S8 567 aa29.28■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 MMP13P45452 471 aa29.28■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 CLCN3P51790 818 aa29.28■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa29.28■■■□□ 2.28
CERS1-201ENST00000429504 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms