RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 SATB2Q9UPW6 733 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 USP32Q8NFA0 1604 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 DFFAO00273 331 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ORC4O43929 436 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 WEE2P0C1S8 567 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TJAP1Q5JTD0 557 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TRIM72Q6ZMU5 477 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 GIMAP4Q9NUV9 329 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TNS2Q63HR2 1409 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 PXDNQ92626 1479 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 F8W8V4 182 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 HUS1O60921 280 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 LCP1P13796 627 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 RCOR2Q8IZ40 523 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 L2HGDHQ9H9P8 463 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 NDFIP2Q9NV92 336 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 MAD2L2Q9UI95 211 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 STAP1Q9ULZ2 295 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 MYO1GB0I1T2 1018 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 UBE2Q2LH0YL09 131 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 RHOBTB3O94955 611 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 S100A5P33763 92 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 CCDC15Q0P6D6 951 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TTLL4Q14679 1199 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 SLC10A5Q5PT55 438 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TAS2R42Q7RTR8 314 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 PTF1AQ7RTS3 328 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TAF6LQ9Y6J9 622 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 PPLO60437 1756 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 C16orf89Q6UX73 402 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 MTMR4Q9NYA4 1195 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 MYMKA6NI61 221 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 GRIN1Q05586 938 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 CHI3L2Q15782 390 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 CCL15Q16663 113 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 DEPDC1Q5TB30 811 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 DUSP10Q9Y6W6 482 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TSPY1Q01534 308 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ANKS1AQ92625 1134 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 MCEEQ96PE7 176 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TASP1Q9H6P5 420 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TBC1D22BQ9NU19 505 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 MAGEA13PA6NCF6 341 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 M0R3G1 203 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 SERPINI2O75830 405 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 FMO5P49326 533 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ERVK-24P63145 666 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 PHF20Q9BVI0 1012 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 BCL9O00512 1426 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 C16orf96A6NNT2 1141 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 PLSCR1O15162 318 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 SRP72O76094 671 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 DDNO94850 711 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 DSG1Q02413 1049 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 CRYMQ14894 314 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 PPP1R18Q6NYC8 613 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ZFYVE19Q96K21 471 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ZBED2Q9BTP6 218 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TEX12Q9BXU0 123 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 VCPKMTQ9H867 229 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ALG6Q9Y672 507 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ARHGEF37A1IGU5 675 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ZBTB39O15060 712 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 KLHL2O95198 593 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 NDUFB10O96000 172 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 MYBP10242 640 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 CIITAP33076 1130 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ZCWPW2Q504Y3 356 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 GJB7Q6PEY0 223 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 CMTM5Q96DZ9 223 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 CCSER1Q9C0I3 900 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 NEUROG2Q9H2A3 272 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TBC1D4O60343 1298 aa15.16■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 LRRC8BQ6P9F7 803 aa15.16■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 POTEAQ6S8J7 498 aa15.16■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TXNRD3Q86VQ6 643 aa15.16■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 SP110Q9HB58 689 aa15.16■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 SLC8A2Q9UPR5 921 aa15.16■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 RFX7Q2KHR2 1363 aa15.16■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TPST1O60507 370 aa15.16■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 EPHX2P34913 555 aa15.16■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
PTPRU-204ENST00000428026 USP10Q14694 798 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms