RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427778.1

LINC00963-204, long intergenic non-protein coding RNA 963, humanhuman

TSL 2

Gene LINC00963, Length 382 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00963-204ENST00000427778 CHAMP1Q96JM3 812 aa9.57□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 POMKQ9H5K3 350 aa9.57□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 NR2E1Q9Y466 385 aa9.57□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 NUB1Q9Y5A7 615 aa9.57□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 A0A1B0GVL5 298 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 H7C4K7 107 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 I3L4J1 428 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 PIRO00625 290 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 ADAM12O43184 909 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 KLRC4O43908 158 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 EXTL3O43909 919 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 ZMYND10O75800 440 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 ABLIM3O94929 683 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 OAZ2O95190 189 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 RPL17P18621 184 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 MCM4P33991 863 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 OR1D2P34982 312 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 SYKP43405 635 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 NDUFA8P51970 172 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 LILRA4P59901 499 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 SPAG1Q07617 926 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 CUL4BQ13620 913 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 UVSSAQ2YD98 709 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 C9orf57Q5W0N0 161 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 TMC5Q6UXY8 1006 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 CEP57Q86XR8 500 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 PALB2Q86YC2 1186 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 C12orf56Q8IXR9 622 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 EFCAB13Q8IY85 973 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 ADSSL1Q8N142 457 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 KREMEN2Q8NCW0 462 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 APPL2Q8NEU8 664 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 SCFD1Q8WVM8 642 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 HPS3Q969F9 1004 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 PAGE5Q96GU1 130 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 CBWD1Q9BRT8 395 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 KIAA1586Q9HCI6 787 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 SERTAD1Q9UHV2 236 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 CDH22Q9UJ99 828 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 MAFFQ9ULX9 164 aa9.56□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa9.55□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 ARHGEF37A1IGU5 675 aa9.55□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 TGFB1I1O43294 461 aa9.55□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 CYP11A1P05108 521 aa9.55□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 TYMPP19971 482 aa9.55□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 CASP1P29466 404 aa9.55□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 AFMP43652 599 aa9.55□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 ROR1Q01973 937 aa9.55□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 PSMD2Q13200 908 aa9.55□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 PTPN21Q16825 1174 aa9.55□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 LIN9Q5TKA1 542 aa9.55□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 TPGS2Q68CL5 300 aa9.55□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 ZNF280DQ6N043 979 aa9.55□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 KANK3Q6NY19 840 aa9.55□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 ARMCX5Q6P1M9 558 aa9.55□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 CCDC149Q6ZUS6 474 aa9.55□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa9.55□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 FRMD5Q7Z6J6 570 aa9.55□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa9.55□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa9.55□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 GPD1LQ8N335 351 aa9.55□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 ZNF461Q8TAF7 563 aa9.55□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 CXorf38Q8TB03 319 aa9.55□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 FAM213AQ9BRX8 229 aa9.55□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 APOL5Q9BWW9 433 aa9.55□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 PRKD2Q9BZL6 878 aa9.55□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 BLZF1Q9H2G9 400 aa9.55□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa9.55□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 FBXL5Q9UKA1 691 aa9.55□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 CDY1Q9Y6F8 540 aa9.55□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 NCOR2Q9Y618 2525 aa9.55□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 CLUHO75153 1309 aa9.55□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 TPRP12270 2363 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 WDR27A2RRH5 827 aa9.54□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 PPEF2O14830 753 aa9.54□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 SPTLC1O15269 473 aa9.54□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 RFPL2O75678 378 aa9.54□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 C8AP07357 584 aa9.54□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 SPATA31D3P0C874 917 aa9.54□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 ATF2P15336 505 aa9.54□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 PNPLA4P41247 253 aa9.54□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 GUCY2FP51841 1108 aa9.54□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 WNT7BP56706 349 aa9.54□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 KRBA2Q6ZNG9 492 aa9.54□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa9.54□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 HS2ST1Q7LGA3 356 aa9.54□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 OTOP3Q7RTS5 596 aa9.54□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 GLYCTKQ8IVS8 523 aa9.54□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 TCEAL8Q8IYN2 117 aa9.54□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 LRRC52Q8N7C0 313 aa9.54□□□□□ -0.88
LINC00963-204ENST00000427778 FSIP1Q8NA03 581 aa9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms