RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 SWSAP1Q6NVH7 229 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 FITM2Q8N6M3 262 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 RMDN2Q96LZ7 410 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 WDR90Q96KV7 1748 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 PI4K2BG5E9Z4 385 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 TCEA3O75764 348 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 NR3C2P08235 984 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 LIG4P49917 911 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 LIN9Q5TKA1 542 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM270Q6UE05 265 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 LGALS13Q9UHV8 139 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 PTPRJQ12913 1337 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 RASA4BC9J798 803 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 RASA4O43374 803 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 RGS20O76081 388 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 BPIFB4P59827 614 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 COPS2P61201 443 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 MAMLD1Q13495 774 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 ACCSLQ4AC99 568 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 CGB2Q6NT52 195 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 DPY19L2Q6NUT2 758 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 KLHL29Q96CT2 875 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC77Q9BR77 488 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 TEX13BQ9BXU2 312 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 C17orf75Q9HAS0 396 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 L3MBTL1Q9Y468 752 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 PSTPIP1O43586 416 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 ELF1P32519 619 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 BNIP1Q12981 228 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM63BQ5T3F8 832 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM47EQ6ZV65 393 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 NCAPG2Q86XI2 1143 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 CYP39A1Q9NYL5 469 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 C19orf81C9J6K1 198 aa19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 TLR3O15455 904 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT10P13645 584 aa19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 GNA15P30679 374 aa19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 MAGEA4P43358 317 aa19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 PTP4A2Q12974 167 aa19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 ZACNQ401N2 412 aa19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 GLIS1Q8NBF1 620 aa19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM212AQ96EL1 285 aa19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 MAGEB18Q96M61 343 aa19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIM33Q9UPN9 1127 aa19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 EXTL3O43909 919 aa19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 RPSAP08865 295 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 NOMO3P69849 1222 aa19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 STAT4Q14765 748 aa19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 KATNAL2Q8IYT4 538 aa19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 BBOF1Q8ND07 529 aa19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 IFT74Q96LB3 600 aa19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 STK38LQ9Y2H1 464 aa19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
SH3BP1-202ENST00000417536 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa19.77■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 SPAG7O75391 227 aa19.77■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 STBD1O95210 358 aa19.77■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 TCF4P15884 667 aa19.77■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 KLRC2P26717 231 aa19.77■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 FOXN2P32314 431 aa19.77■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 MGAT5Q09328 741 aa19.77■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa19.77■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD35Q8N283 1001 aa19.77■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP6V0A1Q93050 837 aa19.77■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 SAYSD1Q9NPB0 183 aa19.77■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 PRKAG3Q9UGI9 489 aa19.77■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 DGAT1O75907 488 aa19.76■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 VNN1O95497 513 aa19.76■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 PGK2P07205 417 aa19.76■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa19.76■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 ACO1P21399 889 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 STRN3Q13033 797 aa19.76■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 RIPK1Q13546 671 aa19.76■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 CAPN12Q6ZSI9 719 aa19.76■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 MCPH1Q8NEM0 835 aa19.76■□□□□ 0.75
SH3BP1-202ENST00000417536 C12orf42Q96LP6 360 aa19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms