RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 TRIM59Q8IWR1 403 aa28.76■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 CLSTN3Q9BQT9 956 aa28.76■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 DNAJC25Q9H1X3 360 aa28.76■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 VRTNQ9H8Y1 702 aa28.76■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 SNX9Q9Y5X1 595 aa28.76■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 SYCE3A1L190 88 aa28.75■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 FAM163BP0C2L3 166 aa28.75■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 MXI1P50539 228 aa28.75■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 ADAM15Q13444 863 aa28.75■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 WDR72Q3MJ13 1102 aa28.75■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 OVOS1Q6IE37 1185 aa28.75■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF280DQ6N043 979 aa28.75■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 CREBRFQ8IUR6 639 aa28.75■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM86AQ8N2M4 240 aa28.75■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 TOP6BLQ8N6T0 577 aa28.75■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 SPATA18Q8TC71 538 aa28.75■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP28.75■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 HLA-DRAP01903 254 aa28.74■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 SRGAP2BP0DMP2 458 aa28.74■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP28.74■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 PIK3CAP42336 1068 aa28.74■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF699Q32M78 642 aa28.74■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 CTXN3Q4LDR2 81 aa28.74■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 IRF2BP1Q8IU81 584 aa28.74■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 THEM5Q8N1Q8 247 aa28.74■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC150Q8NCX0 1101 aa28.74■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 IMPG2Q9BZV3 1241 aa28.74■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 XYLT2Q9H1B5 865 aa28.74■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa28.74■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 PMM2O15305 246 aa28.73■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 TBC1D4O60343 1298 aa28.73■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 RPL17P18621 184 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 TNNC1P63316 161 aa28.73■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 CETN1Q12798 172 aa28.73■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 COL19A1Q14993 1142 aa28.73■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 ANO6Q4KMQ2 910 aa28.73■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF667Q5HYK9 610 aa28.73■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 FBXL13Q8NEE6 735 aa28.73■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 FUCA2Q9BTY2 467 aa28.73■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 DPP7Q9UHL4 492 aa28.73■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 BRWD1Q9NSI6 2320 aa28.73■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 OR6C75A6NL08 312 aa28.72■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 P4HA1P13674 534 aa28.72■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 OR1D2P34982 312 aa28.72■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 FMO5P49326 533 aa28.72■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 CLCN4P51793 760 aa28.72■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 KCNH2Q12809 1159 aa28.72■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 CTC1Q2NKJ3 1217 aa28.72■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa28.72■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 WSCD1Q658N2 575 aa28.72■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 SLC8B1Q6J4K2 584 aa28.72■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa28.72■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 LIMS2Q7Z4I7 341 aa28.72■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 TAS1R2Q8TE23 839 aa28.72■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 SLC22A17Q8WUG5 538 aa28.72■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 MMS19Q96T76 1030 aa28.72■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 BPIFA3Q9BQP9 254 aa28.72■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 FBXL5Q9UKA1 691 aa28.72■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 COQ4Q9Y3A0 265 aa28.72■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 CDY1Q9Y6F8 540 aa28.72■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 P4HA2O15460 535 aa28.71■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 ASS1P00966 412 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 MYL5Q02045 173 aa28.71■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 KCNC3Q14003 757 aa28.71■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 RAB33AQ14088 237 aa28.71■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 SOWAHAQ2M3V2 549 aa28.71■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 GLYCTKQ8IVS8 523 aa28.71■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 PDCL2Q8N4E4 241 aa28.71■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 CASP10Q92851 521 aa28.71■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 RAB20Q9NX57 234 aa28.71■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 CLDND1Q9NY35 253 aa28.71■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 L1RE1Q9UN81 338 aa28.71■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 COG5Q9UP83 839 aa28.71■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa28.71■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 TSC2P49815 1807 aa28.71■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 PLXNA3P51805 1871 aa28.71■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 REV3LO60673 3130 aa28.71■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 CLSTN1O94985 981 aa28.7■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 GLUD1P00367 558 aa28.7■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 AFPP02771 609 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 LHX1P48742 406 aa28.7■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 CBWD6Q4V339 395 aa28.7■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 CBWD3Q5JTY5 395 aa28.7■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 CBWD5Q5RIA9 395 aa28.7■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa28.7■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 PALB2Q86YC2 1186 aa28.7■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 HLA-CQ95604 372 aa28.7■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.19
CRIP1-201ENST00000330233 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 WDR44Q5JSH3 913 aa28.69■■■□□ 2.18
CRIP1-201ENST00000330233 LILRA6Q6PI73 481 aa28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms