RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 ORC1Q13415 861 aa24.23■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 PLA2G4AP47712 749 aa24.23■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 LIN9Q5TKA1 542 aa24.23■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 CXCL17Q6UXB2 119 aa24.23■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 WNT8AQ9H1J5 351 aa24.23■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 VRTNQ9H8Y1 702 aa24.23■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 ITGA11Q9UKX5 1188 aa24.23■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 RAD51CO43502 376 aa24.22■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP24.22■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 CD302Q8IX05 232 aa24.22■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 VCPIP1Q96JH7 1222 aa24.22■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 SNX27Q96L92 541 aa24.22■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 HMGXB4Q9UGU5 601 aa24.22■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 NR2E1Q9Y466 385 aa24.22■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 MAP2K7O14733 419 aa24.22■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 ALDH1A1P00352 501 aa24.22■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 GNAT1P11488 350 aa24.22■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 MMP8P22894 467 aa24.22■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 HDXQ7Z353 690 aa24.22■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 NT5DC4Q86YG4 428 aa24.22■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 RUBCNQ92622 972 aa24.22■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 FAXDC2Q96IV6 333 aa24.22■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 TWNKQ96RR1 684 aa24.22■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 RNF19AQ9NV58 838 aa24.22■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 CD19P15391 556 aa24.21■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 RAD23BP54727 409 aa24.21■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 RBP5P82980 135 aa24.21■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 MAMLD1Q13495 774 aa24.21■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 KRT222Q8N1A0 295 aa24.21■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 WDTC1Q8N5D0 677 aa24.21■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 WHAMMQ8TF30 809 aa24.21■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa24.21■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 APOL6Q9BWW8 343 aa24.21■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa24.21■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa24.21■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 GJB6O95452 261 aa24.2■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 MAP9Q49MG5 647 aa24.2■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 PCDHGC3Q9UN70 934 aa24.2■■□□□ 1.47
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC188H7C350 402 aa24.2■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 MYO1FO00160 1098 aa24.2■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 LSM8O95777 96 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 AKAP5P24588 427 aa24.2■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 CTNNA2P26232 953 aa24.2■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 GUCY2DQ02846 1103 aa24.2■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 CASP8Q14790 479 aa24.2■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 GLRA4Q5JXX5 417 aa24.2■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa24.2■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM35BQ8NCS4 154 aa24.2■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 ESYT3A0FGR9 886 aa24.19■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC66A2RUB6 948 aa24.19■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 SART1O43290 800 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 KPNA6O60684 536 aa24.19■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 CILPO75339 1184 aa24.19■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 PYGMP11217 842 aa24.19■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 AXLP30530 894 aa24.19■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 YARSP54577 528 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 NBPF20Q3BBV1 942 aa24.19■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa24.19■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 NME8Q8N427 588 aa24.19■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 SLC4A11Q8NBS3 891 aa24.19■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 ELOVL4Q9GZR5 314 aa24.19■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 EPB41L5Q9HCM4 733 aa24.19■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 RECQL4O94761 1208 aa24.19■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 P4HA1P13674 534 aa24.19■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 DENND1BQ6P3S1 775 aa24.19■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 GDF3Q9NR23 364 aa24.19■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa24.19■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 CITO14578 2027 aa24.19■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 DNAH12Q6ZR08 3092 aa24.18■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 SEPT4O43236 478 aa24.18■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 NOGQ13253 232 aa24.18■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 ZBTB6Q15916 424 aa24.18■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa24.18■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 ZBTB9Q96C00 473 aa24.18■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 CYP3A43Q9HB55 503 aa24.18■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 DERAQ9Y315 318 aa24.18■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 PPEF2O14830 753 aa24.18■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 PAEPP09466 180 aa24.18■■□□□ 1.46
VSTM4-201ENST00000298454 RARBP10826 455 aa24.18■■□□□ 1.46
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