RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267176.8

SBNO1-201, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SBNO1, Length 11,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-201ENST00000267176 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 C16orf96A6NNT2 1141 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 WDR47O94967 919 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 RPS6P62753 249 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 C12orf60Q5U649 245 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 TRIM65Q6PJ69 517 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 PLD3Q8IV08 490 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 CSPG5O95196 566 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 RBP3P10745 1247 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 PON1P27169 355 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 NLRP9Q7RTR0 991 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 NFIBO00712 420 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 TMEM253P0C7T8 217 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 RARGP13631 454 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 SERPINB5P36952 375 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 SPDYAQ5MJ70 313 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 TRAF7Q6Q0C0 670 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 MTHFD1LQ6UB35 978 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 LAYNQ6UX15 382 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 ACTRT1Q8TDG2 376 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 TMEM237Q96Q45 408 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 HPSEQ9Y251 543 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 CDY2AQ9Y6F7 541 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 CDY1Q9Y6F8 540 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 CLPTM1O96005 669 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 C6orf10Q5SRN2 563 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 MFSD4BQ5TF39 518 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 FOXP3Q9BZS1 431 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 MAD2L2Q9UI95 211 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 CHD1O14646 1710 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 LCP1P13796 627 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 PRUNE1Q86TP1 453 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 ATG4AQ8WYN0 398 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 IL1RL2Q9HB29 575 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 OLFML3Q9NRN5 406 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 CALB2P22676 271 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 PTPAQ15257 358 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 TFDP3Q5H9I0 405 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 KIAA1841Q6NSI8 718 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 LRRC6Q86X45 466 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 A2ML1A8K2U0 1454 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 CST8O60676 142 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 PDGFRAP16234 1089 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 KCNA2P16389 499 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 ADORA2BP29275 332 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 CLK1P49759 484 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 IYDQ6PHW0 289 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 CDYLQ9Y232 598 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 ATP8B3O60423 1300 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 M0R3G1 203 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 PSMC3P17980 439 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 USP10Q14694 798 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 INPP5DQ92835 1189 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 WNK4Q96J92 1243 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 V9GYQ6 96 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 A8MXQ7 604 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 GRAP2O75791 330 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 GNAT1P11488 350 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 PAX7P23759 505 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 CDC25CP30307 473 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 SERPINB1P30740 379 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 CCNA1P78396 465 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 DPY19L2Q6NUT2 758 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 HDAC7Q8WUI4 952 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa6.63□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 TNFAIP2Q03169 654 aa6.62□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 UBE3AQ05086 875 aa6.62□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 CATSPER4Q7RTX7 472 aa6.62□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 SCN4BQ8IWT1 228 aa6.62□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa6.62□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 GID8Q9NWU2 228 aa6.62□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 CRB1P82279 1406 aa6.62□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 MAP3K6O95382 1288 aa6.62□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 IZUMO2Q6UXV1 221 aa6.62□□□□□ -1.35
SBNO1-201ENST00000267176 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.62□□□□□ -1.35
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