RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000211953.1

Lncbate1-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Lncbate1, Length 812 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 P01650 108 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 P01653 108 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Hoxb8P09632 243 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Mdh1P14152 334 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Xrcc6P23475 608 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gna15P30678 374 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gnl1P36916 607 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 NsfP46460 744 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Nr2c2P49117 596 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 UrosP51163 265 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ctc1Q5SUQ9 1212 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Klra4Q60651 263 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Tmem45aQ60774 273 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ctnna2Q61301 953 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Pick1Q62083 416 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Tlr11Q6R5P0 926 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Klhl17Q6TDP3 640 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Arhgap10Q6Y5D8 786 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Zfyve28Q6ZPK7 905 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Olfr23Q7TRX4 325 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 CyldQ80TQ2 952 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 LppQ8BFW7 613 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Q8BGC1 442 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Tbc1d10bQ8BHL3 798 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Fam49aQ8BHZ0 323 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Wdr35Q8BND3 1181 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 NcaphQ8C156 731 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Q8CCC3 530 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Zbtb9Q8CDC7 459 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ccdc73Q8CDM4 1066 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gpc3Q8CFZ4 579 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 IntS13Q8QZV7 732 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Znf830Q8R1N0 363 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Vmn1r218Q8R261 298 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 BbxQ8VBW5 907 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Olfr1494Q8VGP8 315 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Olfr393Q8VGR6 312 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Pqbp1Q91VJ5 263 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Prkag2Q91WG5 566 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Pcdhgb4Q91XX6 912 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 CmasQ99KK2 432 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Q9D2Q3 444 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gdap2Q9DBL2 498 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Tmem174Q9DCX7 243 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Rdh14Q9ERI6 334 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Trp53inp1Q9QXE4 239 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Pdzd4Q9QY39 772 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Grk1Q9WVL4 564 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Atp6v0a1Q9Z1G4 839 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Arih2Q9Z1K6 492 aa7.54□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Trbv21A0A0A6YX06 97 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Cdr2lA2A6T1 465 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Btnl4A2CG29 586 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Slc35g2D3YVE8 412 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gm3252E9PUT9 216 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Hsd17b14E9Q3D4 273 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Myo1eE9Q634 1107 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gm3468E9QAJ8 216 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gm5160F8VPN3 147 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Pex5O09012 639 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Guca2bO09051 106 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 MycP01108 439 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ifnb1P01575 182 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 AlbP07724 608 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Becn2P0DM65 447 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 PkmP52480 531 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gabrb2P63137 512 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Frg1P97376 258 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ect2Q07139 913 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Atp8b1Q148W0 1251 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Znhit6Q3UFB2 460 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 B230104I21RikQ3USW4 141 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 BC051142Q3V0M8 400 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Dzip1lQ499E4 774 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Zfp658Q5PPQ4 887 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ccdc85aQ5SP85 500 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Elf1Q60775 612 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Znf235Q61116 645 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 EsrrbQ61539 433 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Cyp3a16Q64481 504 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Kiaa0754Q69ZZ9 979 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gucy2gQ6TL19 1100 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Jade1Q6ZPI0 834 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 PrcpQ7TMR0 491 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Pja2Q80U04 707 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Cfap100Q80VN0 613 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Spata7Q80VP2 582 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Rhbdf2Q80WQ6 827 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Impg2Q80XH2 1243 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Spata20Q80YT5 790 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Dars2Q8BIP0 653 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Slc7a14Q8BXR1 771 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ccdc15Q8C9M2 810 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ccdc87Q8CDL9 855 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Tmem132cQ8CEF9 1099 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Polr2bQ8CFI7 1174 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Unc45bQ8CGY6 931 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 UvragQ8K245 698 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Zdhhc3Q8R173 299 aa7.53□□□□□ -1.2
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Unc93b1Q8VCW4 598 aa7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.7 ms