RNA–Protein interactions for RNA: tW(UCA)Q

tW(UCA)Q, Transcript of Mitochondrial tRNA, annotated as tryptophanyl tRNA (tRNA-Trp), yeastyeast

Gene tW(UCA)Q, Length 74 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(UCA)QtW(UCA)Q MED4Q12343 284 aa-0.22□□□□□ -2.44
tW(UCA)QtW(UCA)Q KSS1P14681 368 aa-0.23□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q MRPL25P23369 157 aa-0.23□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q YHL018WP38744 120 aaPredicted RBP-0.23□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q PRP11Q07350 266 aaPredicted RBP-0.23□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q DGA1Q08650 418 aa-0.23□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q DRS2P39524 1355 aa-0.23□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPB3P16370 318 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q ATP15P21306 62 aa-0.24□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q MGM101P32787 269 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q NTF2P33331 125 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q TVP23P38962 199 aa-0.24□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q YFL051CP43552 160 aa-0.24□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q MET31Q03081 177 aa-0.24□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q FYV12Q08559 129 aa-0.24□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q RRP36Q12481 300 aaPredicted RBP-0.24□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q OM45P16547 393 aa-0.25□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q SEN2P16658 377 aa-0.25□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q IDH1P28834 360 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.25□□□□□ -2.45not detected
tW(UCA)QtW(UCA)Q GCN20P43535 752 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q ALB1P47019 175 aaPredicted RBP-0.25□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q COX8P04039 78 aa-0.26□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q URA6P15700 204 aa-0.26□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q MPC3P53311 146 aa-0.26□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q YNL134CP53912 376 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q FYV6P53913 173 aa-0.26□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q PAM18Q07914 168 aa-0.26□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q SEY1Q99287 776 aa-0.26□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q PTM1P32857 523 aa-0.27□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q APS1P35181 156 aa-0.27□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q MAK5P38112 773 aaPredicted RBP-0.27□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q AST2P39945 430 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q LIA1P47120 325 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q FIT1Q04433 528 aa-0.27□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q ABP140Q08641 628 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q FIT2Q08906 153 aa-0.27□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q PHO85P17157 305 aa-0.28□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPO26P20435 155 aa-0.28□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q SFK1P35735 353 aa-0.28□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q PAN3P36102 679 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q RMD6P39975 231 aa-0.28□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q YJR015WP47090 510 aa-0.28□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q BRR6P53062 197 aa-0.28□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q GET1P53192 235 aa-0.28□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q THG1P53215 237 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
tW(UCA)QtW(UCA)Q CDC28P00546 298 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
tW(UCA)QtW(UCA)Q POR1P04840 283 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
tW(UCA)QtW(UCA)Q CKS1P20486 150 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
tW(UCA)QtW(UCA)Q ARO7P32178 256 aa-0.29□□□□□ -2.46
tW(UCA)QtW(UCA)Q YGR050CP53231 118 aa-0.29□□□□□ -2.46
tW(UCA)QtW(UCA)Q NOP19P53317 196 aaPredicted RBP-0.29□□□□□ -2.46
tW(UCA)QtW(UCA)Q RRN5Q02983 363 aa-0.29□□□□□ -2.46
tW(UCA)QtW(UCA)Q TMA23Q03525 211 aa-0.29□□□□□ -2.46
tW(UCA)QtW(UCA)Q FAS1P07149 2051 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
tW(UCA)QtW(UCA)Q SSO1P32867 290 aa-0.3□□□□□ -2.46
tW(UCA)QtW(UCA)Q BXI1P48558 297 aa-0.3□□□□□ -2.46
tW(UCA)QtW(UCA)Q RNH202Q05635 350 aa-0.3□□□□□ -2.46
tW(UCA)QtW(UCA)Q ATG31Q12421 196 aa-0.3□□□□□ -2.46
tW(UCA)QtW(UCA)Q YHR213W-BQ8TGK1 99 aa-0.3□□□□□ -2.46
tW(UCA)QtW(UCA)Q VPS71Q03433 280 aa-0.31□□□□□ -2.46
tW(UCA)QtW(UCA)Q IRC23Q08416 157 aa-0.31□□□□□ -2.46
tW(UCA)QtW(UCA)Q YPR013CQ12145 317 aa-0.31□□□□□ -2.46
tW(UCA)QtW(UCA)Q TAR1Q8TGM6 124 aa-0.31□□□□□ -2.46
tW(UCA)QtW(UCA)Q YFR032C-BQ8TGU2 87 aa-0.31□□□□□ -2.46
tW(UCA)QtW(UCA)Q CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
tW(UCA)QtW(UCA)Q SEC4P07560 215 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
tW(UCA)QtW(UCA)Q MAG1P22134 296 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
tW(UCA)QtW(UCA)Q MIC26P50087 233 aa-0.32□□□□□ -2.46
tW(UCA)QtW(UCA)Q COG5P53951 403 aa-0.32□□□□□ -2.46
tW(UCA)QtW(UCA)Q ELP6Q04868 273 aa-0.32□□□□□ -2.46
tW(UCA)QtW(UCA)Q BNA6P43619 295 aa-0.33□□□□□ -2.46
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPC17P47076 161 aa-0.33□□□□□ -2.46
tW(UCA)QtW(UCA)Q PET191Q02772 108 aa-0.33□□□□□ -2.46
tW(UCA)QtW(UCA)Q YMR295CQ03559 197 aa-0.33□□□□□ -2.46
tW(UCA)QtW(UCA)Q HNT1Q04344 158 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
tW(UCA)QtW(UCA)Q GSP2P32836 220 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
tW(UCA)QtW(UCA)Q HHY1P39982 102 aa-0.34□□□□□ -2.46
tW(UCA)QtW(UCA)Q YDC1Q02896 317 aa-0.34□□□□□ -2.46
tW(UCA)QtW(UCA)Q DYN3Q04949 312 aa-0.34□□□□□ -2.46
tW(UCA)QtW(UCA)Q YNG1Q08465 219 aa-0.34□□□□□ -2.46
tW(UCA)QtW(UCA)Q GET4Q12125 312 aa-0.34□□□□□ -2.46
tW(UCA)QtW(UCA)Q YOL107WQ12239 342 aa-0.34□□□□□ -2.46
tW(UCA)QtW(UCA)Q YCR090CP25654 182 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
tW(UCA)QtW(UCA)Q OCH1P31755 480 aa-0.35□□□□□ -2.47
tW(UCA)QtW(UCA)Q COX15P40086 486 aa-0.35□□□□□ -2.47
tW(UCA)QtW(UCA)Q UPS1Q05776 175 aa-0.35□□□□□ -2.47
tW(UCA)QtW(UCA)Q KAP95Q06142 861 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
tW(UCA)QtW(UCA)Q KEI1Q06346 221 aa-0.35□□□□□ -2.47
tW(UCA)QtW(UCA)Q YCR001WP25347 104 aa-0.36□□□□□ -2.47
tW(UCA)QtW(UCA)Q PTC1P35182 281 aa-0.36□□□□□ -2.47
tW(UCA)QtW(UCA)Q SBH2P52871 88 aa-0.36□□□□□ -2.47
tW(UCA)QtW(UCA)Q MGA1P53050 456 aa-0.36□□□□□ -2.47
tW(UCA)QtW(UCA)Q SRL4Q03085 281 aa-0.36□□□□□ -2.47
tW(UCA)QtW(UCA)Q SHH3Q04487 196 aa-0.36□□□□□ -2.47
tW(UCA)QtW(UCA)Q YLR283WQ05867 314 aa-0.36□□□□□ -2.47
tW(UCA)QtW(UCA)Q JLP1Q12358 412 aa-0.36□□□□□ -2.47
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPL25P04456 142 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
tW(UCA)QtW(UCA)Q YOL013W-AP0C272 63 aaPredicted RBP-0.37□□□□□ -2.47
tW(UCA)QtW(UCA)Q YPK2P18961 677 aa-0.37□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 52.5 ms