RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A PGA3Q12746 312 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A YPR117WQ06116 2489 aa-0.54□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A RPL28P02406 149 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A DAL82P21705 255 aa-0.54□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A HTD2P38790 280 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A PEX18P38855 283 aa-0.54□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A YMR295CQ03559 197 aa-0.54□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A YBL112CQ3E7Y4 105 aa-0.54□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A YHR213W-BQ8TGK1 99 aa-0.54□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A PET18P25362 215 aa-0.55□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A ATX1P38636 73 aa-0.55□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A YHR180WP38868 163 aa-0.55□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A PDR16P53860 351 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A FAR8Q05040 523 aa-0.55□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A MSN4P33749 630 aa-0.55□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A YPT52P36018 234 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A YGL159WP53110 370 aa-0.55□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A COQ10Q08058 207 aa-0.55□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A ADF1Q2V2Q1 113 aa-0.55□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A CYR1P08678 2026 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A SPO13P23624 291 aa-0.56□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A URA8P38627 578 aaPredicted RBP-0.56□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A SSO2P39926 295 aa-0.56□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A YPL073CP40323 161 aa-0.56□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A SNZ3P43545 298 aa-0.56□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A NOP6Q07623 225 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A NIP7Q08962 181 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A DGK1Q12382 290 aa-0.56□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A OM45P16547 393 aa-0.56□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A SEN2P16658 377 aa-0.56□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A JEN1P36035 616 aa-0.56□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A CUE1P38428 203 aa-0.56□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A YJL009WP47078 108 aa-0.56□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A GET1P53192 235 aa-0.56□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A SPG4Q04438 115 aa-0.56□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A TRA1P38811 3744 aa-0.56□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A MRPL37P36532 105 aa-0.56□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A GAA1P39012 614 aa-0.56□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A COX15P40086 486 aa-0.56□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A YLR126CQ12288 251 aa-0.56□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A ATG40Q99325 256 aa-0.56□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A SRB4P32569 687 aa-0.57□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A YEA4P40004 342 aa-0.57□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A KNH1P50112 268 aa-0.57□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A ABZ2Q03266 374 aa-0.57□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A VPS71Q03433 280 aa-0.57□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A IRC23Q08416 157 aa-0.57□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A SYC1Q08553 188 aaPredicted RBP-0.57□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A ABP140Q08641 628 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A DDI1P40087 428 aa-0.57□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A FIT1Q04433 528 aa-0.57□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A RRG8Q06109 277 aa-0.57□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A NOT5Q12514 560 aaPredicted RBP-0.57□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A TSC3Q3E790 80 aa-0.57□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A GCY1P14065 312 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.58□□□□□ -2.5not detected
YPL060C-AYPL060C-A YGL034CP53186 121 aa-0.58□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A YLR413WQ06689 675 aa-0.58□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A LSO2Q3E772 92 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A RPL27BP0C2H7 136 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A RSR1P13856 272 aa-0.58□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.58□□□□□ -2.5not detected
YPL060C-AYPL060C-A CWC27Q02770 301 aa-0.58□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A PIR1Q03178 341 aa-0.58□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A TIM9O74700 87 aa-0.58□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A TOM40P23644 387 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A FUS2Q05670 677 aa-0.58□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A GGA1Q06336 557 aa-0.58□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A TPO4Q12256 659 aa-0.58□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A TDA8Q6B2U8 126 aa-0.58□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A ISN1Q99312 450 aa-0.58□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A BCY1P07278 416 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A SNA3P14359 133 aa-0.59□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A DBP3P20447 523 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A PAA1Q12447 191 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A IDH1P28834 360 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.59□□□□□ -2.5not detected
YPL060C-AYPL060C-A HOM6P31116 359 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A ECM13P38195 257 aa-0.59□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A DOG2P38773 246 aa-0.59□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A DOG1P38774 246 aa-0.59□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A YHR122WP38829 231 aa-0.59□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A BFR1P38934 470 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.59□□□□□ -2.5not detected
YPL060C-AYPL060C-A PEX17P40155 199 aa-0.59□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A YJR056CP47115 236 aa-0.59□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A NAT3Q06504 195 aa-0.59□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A UGX2P32772 223 aa-0.59□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A PET191Q02772 108 aa-0.59□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A YDR286CQ05530 114 aa-0.59□□□□□ -2.5
YPL060C-AYPL060C-A FMP27Q06179 2628 aa-0.6□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A GSP2P32836 220 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A YKL102CP34249 101 aa-0.6□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A SFK1P35735 353 aa-0.6□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A ADH5P38113 351 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A YJR015WP47090 510 aa-0.6□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A ADO1P47143 340 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A PNC1P53184 216 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A SEY1Q99287 776 aa-0.6□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A LAA1P39526 2014 aa-0.6□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A SLH1P53327 1967 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A ARO7P32178 256 aa-0.6□□□□□ -2.51
YPL060C-AYPL060C-A MRPL15P36523 253 aa-0.6□□□□□ -2.51
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