RNA–Protein interactions for RNA: YOR373W

NUD1, Transcript of Component of the spindle pole body outer plaque, yeast

Gene NUD1, Length 2,556 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NUD1	YOR373W	CHL4	P38907	458 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	YER076C	P40049	302 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	LYS5	P50113	272 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	CPD1	P53314	239 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	GPI17	Q04080	534 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	SPC3	Q12133	184 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	FYV7	Q12247	151 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	IZH2	Q12442	317 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	YOR304C-A	O14468	76 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	MSW1	P04803	379 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	SPS18	P32572	300 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	MTC6	P38849	526 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	RRG9	P40156	214 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	YCH1	P42937	148 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	MOB2	P43563	287 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	OST3	P48439	350 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	LST7	P53237	242 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	FRQ1	Q06389	190 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	MIM1	Q08176	113 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	QRI5	P32344	111 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	YKL075C	P36083	450 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	FCY21	P40039	528 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	UBC11	P52492	156 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	POP6	P53218	158 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	COS1	P53822	381 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	AIM34	Q03673	198 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	MED7	Q08278	222 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	TRM10	Q12400	293 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	OAC1	P32332	324 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	YBR220C	P38318	560 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	YFL051C	P43552	160 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	BRR6	P53062	197 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	MTM1	P53320	366 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	FMP23	P38231	175 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	SIP18	P50263	79 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	GPI15	P53961	229 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	YLR152C	P54072	576 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	AIM36	Q03798	255 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.73	□□□□□ -1.65	not detected
NUD1	YOR373W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	IFM1	P25038	676 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	YCR023C	P25351	611 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	ARO7	P32178	256 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	IPT1	P38954	527 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	YMR279C	Q03263	540 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	TDA6	Q06466	467 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	SEC22	P22214	214 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	UGX2	P32772	223 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	CWC27	Q02770	301 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	TAZ1	Q06510	381 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	HRT1	Q08273	121 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	SRL2	Q12020	392 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	PCL9	Q12477	304 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	TIM9	O74700	87 aa		4.71	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	ERG4	P25340	473 aa		4.71	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	ZRT1	P32804	376 aa		4.71	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	RCN1	P36054	211 aa		4.71	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	YHR035W	P38769	630 aa		4.71	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	NVJ1	P38881	321 aa		4.71	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	YER084W	P40057	128 aa		4.71	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	CPR8	P53728	308 aa		4.71	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	HHT1	P61830	136 aa		4.71	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	RAX2	Q12465	1220 aa		4.71	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		4.71	□□□□□ -1.65
NUD1	YOR373W	MEC1	P38111	2368 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NUD1	YOR373W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
NUD1	YOR373W	SPS100	P13130	326 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NUD1	YOR373W	MRPL28	P36527	147 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NUD1	YOR373W	PEX7	P39108	375 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NUD1	YOR373W	YJR012C	P47087	207 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NUD1	YOR373W	MST27	P53176	234 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NUD1	YOR373W	YNL046W	P53956	172 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NUD1	YOR373W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
NUD1	YOR373W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NUD1	YOR373W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
NUD1	YOR373W	RPS23B	P0CX30	145 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NUD1	YOR373W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
NUD1	YOR373W	APL3	P38065	1025 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NUD1	YOR373W	CAF40	P53829	373 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NUD1	YOR373W	PDR17	P53844	350 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NUD1	YOR373W	CTR3	Q06686	241 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NUD1	YOR373W	SAL1	D6W196	494 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NUD1	YOR373W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NUD1	YOR373W	GCN3	P14741	305 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NUD1	YOR373W	CLB6	P32943	380 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NUD1	YOR373W	YBR137W	P38276	179 aa		4.7	□□□□□ -1.66

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