RNA–Protein interactions for RNA: YOL004W

SIN3, Transcript of Component of both the Rpd3S and Rpd3L histone deacetylase complexes, yeastyeast

Gene SIN3, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIN3YOL004W RFT1P38206 574 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W MTC6P38849 526 aa2.33□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W YNL095CP53932 642 aa2.33□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W RIM13Q03792 727 aa2.33□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W SFH1Q06168 426 aa2.33□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W YCT1Q12235 531 aa2.33□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W PET20Q99373 253 aa2.33□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W PIS1P06197 220 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W CMD1P06787 147 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W UPS2P35200 230 aa2.33□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W ARC40P38328 384 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W CCT4P39078 528 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W YGL235WP53071 178 aa2.33□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W SHY1P53266 389 aa2.33□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W SMX3P54999 86 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W ABF2Q02486 183 aa2.33□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W YDR124WQ04608 324 aa2.33□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W YMR316C-AI2HB70 103 aa2.33□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W NSP1P14907 823 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W FRE2P36033 711 aa2.33□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W RIB5P38145 238 aa2.33□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W PTH1P38876 190 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W PDS1P40316 373 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W YPL150WQ12152 901 aa2.33□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W TFS1P14306 219 aa2.32□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W CUP2P15315 225 aa2.32□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W MRPL6P32904 214 aa2.32□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W YMR027WQ04371 470 aa2.32□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W YEH2Q07950 538 aa2.32□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W SFM1Q12314 213 aa2.32□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W DDP1Q99321 188 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W RPL16AP26784 199 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W TIP1P27654 210 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W ARO7P32178 256 aa2.32□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W MCH2P36032 473 aa2.32□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W MIT1P40002 666 aa2.32□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W BUL1P48524 976 aa2.32□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W SHE1P38200 338 aa2.32□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W BMT2P38278 337 aa2.32□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W PRM10P42946 383 aa2.32□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W COS6P53344 381 aa2.32□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W YNR048WP53740 393 aa2.32□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W YDL085C-AQ3E7B7 68 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W RFA3P26755 122 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W GGC1P38988 300 aa2.32□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W YIL060WP40519 144 aa2.32□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W MGA1P53050 456 aa2.32□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W MST27P53176 234 aa2.32□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W YIP3P53633 176 aa2.32□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W NRK1P53915 240 aa2.32□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W ODC1Q03028 310 aa2.32□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W COA4Q05809 96 aa2.32□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W RPL31AP0C2H8 113 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W JLP2P40206 208 aa2.31□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W FAR7P43592 221 aa2.31□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W YLR050CQ12155 161 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W SME1Q12330 94 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W YDL199CQ12407 687 aa2.31□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W YCL048W-AQ2V2Q2 79 aa2.31□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W YPL119C-AQ3E751 87 aa2.31□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W IDP1P21954 428 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W TRX3P25372 127 aa2.31□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W SPO23P33757 523 aa2.31□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W KRE29P40026 464 aa2.31□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W YER189WP40104 122 aa2.31□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W MEP2P41948 499 aa2.31□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W ILM1P47155 203 aa2.31□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W JAC1P53193 184 aa2.31□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W NSL1Q12143 216 aa2.31□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W BI3Q9ZZW7 517 aa2.31□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W BLM10P43583 2143 aa2.31□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W YDR157WA0A023PZE8 133 aa2.31□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W PBI2P0CT04 75 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W CAM1P29547 415 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W SPT4P32914 102 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W HAC1P41546 238 aa2.31□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W RAV2Q03956 351 aa2.31□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W DPM1P14020 267 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W YDR248CQ03786 193 aa2.3□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W GPA2P10823 449 aa2.3□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W QRI5P32344 111 aa2.3□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W MTM1P53320 366 aa2.3□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W BBP1Q12365 385 aa2.3□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W POF1P25576 258 aa2.3□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W URA10P30402 227 aa2.3□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W IRC18P47056 224 aa2.3□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W TIM13P53299 105 aa2.3□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W YLR152CP54072 576 aa2.3□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W DPP1Q05521 289 aa2.3□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W SNX3Q08826 162 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W CAP2P13517 287 aa2.3□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W PSA1P41940 361 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W VBA1Q04301 562 aa2.3□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W FAR1P21268 830 aa2.29□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W ILV6P25605 309 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W RPF1P38805 295 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W MST28P39552 234 aa2.29□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W TTI2P47168 421 aa2.29□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W URA6P15700 204 aa2.29□□□□□ -2.04
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