RNA–Protein interactions for RNA: YMR308C

PSE1, Transcript of Karyopherin/importin that interacts with the nuclear pore complex, yeast

Gene PSE1, Length 3,270 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSE1	YMR308C	SWC7	Q06707	132 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	YOL024W	Q08172	172 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	MMT2	Q08970	484 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	COX10	P21592	462 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	TEM1	P38987	245 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	YFL065C	P43539	102 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	PRY1	P47032	299 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	HMS2	P47175	358 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	YMR166C	Q03829	368 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	YPR203W	Q08994	102 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	TY4B-J	P47024	1803 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	VMA21	P41806	77 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	FAR3	P46671	204 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	GCV1	P48015	400 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	ENB1	Q08299	606 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	SDH4	P37298	181 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	YPS6	P40583	537 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	SFT1	P43682	97 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	RCE1	Q03530	315 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	CRD1	Q07560	283 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	MSW1	P04803	379 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	SAM35	P14693	329 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.36	□□□□□ -1.71	not detected
PSE1	YMR308C	YCR007C	P25354	239 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	EGT2	P42835	1041 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	TAD2	P47058	250 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	SCW11	P53189	542 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	VBA1	Q04301	562 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	YRF1-2	P40105	1681 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	PUS2	P53167	370 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	AIM11	P87275	137 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	COA6	Q3E846	104 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	HTA1	P04911	132 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	HTA2	P04912	132 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	ANB1	P19211	157 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	YIL012W	P40551	113 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	YGR039W	P53225	103 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	YKR011C	Q02209	353 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	MRX11	Q03079	207 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	FRE7	Q12333	620 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	SNO3	P43544	222 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	SBH1	P52870	82 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	CAB4	P53332	305 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	SNO2	P53823	222 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	MSS11	Q03825	758 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	YMR087W	Q04299	284 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	TAZ1	Q06510	381 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	YDL218W	Q07629	317 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	SOR2	Q07786	357 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	MRS1	P07266	363 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	YIH1	P25637	258 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	MTC7	P32633	139 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	COX13	P32799	129 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	YEA4	P40004	342 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	STP4	Q07351	490 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	ZRT3	P34240	503 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	PRM5	P40476	318 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	GON7	P46984	123 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	MSY1	P48527	492 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	NMA2	P53204	395 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	YGR168C	P53293	376 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	HEM25	Q07534	307 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	VTH1	P40438	1549 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	VTH2	P40890	1549 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PSE1	YMR308C	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.72
PSE1	YMR308C	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.72
PSE1	YMR308C	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.34	□□□□□ -1.72
PSE1	YMR308C	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.72
PSE1	YMR308C	PEX34	P25584	144 aa		4.34	□□□□□ -1.72
PSE1	YMR308C	UTR5	P32630	166 aa		4.34	□□□□□ -1.72

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