RNA–Protein interactions for RNA: YLR369W

SSQ1, Transcript of Mitochondrial hsp70-type molecular chaperone, yeastyeast

Gene SSQ1, Length 1,974 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1YLR369W YHR213W-AQ8TGT4 77 aa1.67□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W TDH2P00358 332 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W TDH3P00359 332 aaKnown RBP RIP-Chip data1.66□□□□□ -2.14not detected
SSQ1YLR369W SCEIP03882 235 aa1.66□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W NFT1P0CE68 1218 aa1.66□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W INO2P26798 304 aa1.66□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W PEX3P28795 441 aa1.66□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W HMX1P32339 317 aa1.66□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W TFC1P32367 649 aa1.66□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W AIM29P36154 155 aa1.66□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W ADH5P38113 351 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W IST2P38250 946 aa1.66□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W EGD2P38879 174 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W YGR210CP42942 411 aa1.66□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W PIR5P46999 287 aa1.66□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W BAT2P47176 376 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W SLX9P53251 210 aaPredicted RBP1.66□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W ACT1P60010 375 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W NUP49Q02199 472 aa1.66□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W MRPS17Q03246 237 aaPredicted RBP1.66□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W BET5Q03630 159 aa1.66□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W YPR098CQ06089 161 aa1.66□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W YLR173WQ06247 608 aa1.66□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W TIM18Q08749 192 aa1.66□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W FCY1Q12178 158 aa1.66□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W SFM1Q12314 213 aa1.66□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W PAA1Q12447 191 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W FMP16Q12497 93 aa1.66□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W MSW1P04803 379 aa1.65□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W MATALPHA1P0CY06 175 aa1.65□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W HMLALPHA1P0CY07 175 aa1.65□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W IFM1P25038 676 aa1.65□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W CNB1P25296 175 aa1.65□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W ARO2P28777 376 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W IDH1P28834 360 aaKnown RBP RIP-Chip data1.65□□□□□ -2.14not detected
SSQ1YLR369W YUH1P35127 236 aa1.65□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W RIB5P38145 238 aa1.65□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W NVJ1P38881 321 aa1.65□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W MLH1P38920 769 aa1.65□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W MST28P39552 234 aa1.65□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W MPM1P40364 252 aa1.65□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W WWM1P43582 211 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W DIE2P50076 525 aa1.65□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W VOA1P53262 265 aa1.65□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W RSM27P53305 110 aa1.65□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W SSU72P53538 206 aaPredicted RBP1.65□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W HHT1P61830 136 aa1.65□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W ARL3Q02804 198 aa1.65□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W AIM36Q03798 255 aa1.65□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W GIM5Q04493 163 aa1.65□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W MSC3Q05812 728 aa1.65□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W SYC1Q08553 188 aaPredicted RBP1.65□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W YPR063CQ12160 140 aa1.65□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W ORT1Q12375 292 aa1.65□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W DGK1Q12382 290 aa1.65□□□□□ -2.14
SSQ1YLR369W PET54P10834 293 aa1.65□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W STE18P18852 110 aa1.65□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W SAG1P20840 650 aa1.65□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W LSB5P25369 354 aa1.65□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W TCA17P32613 152 aa1.65□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W YEL045CP32616 141 aa1.65□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W SKG1P36169 355 aa1.65□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W SDH4P37298 181 aa1.65□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W SSH1P38353 490 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W COS8P38723 381 aa1.65□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W GOS1P38736 223 aa1.65□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W CIN2P46670 268 aa1.65□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W XPT1P47165 209 aa1.65□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W ARO8P53090 500 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W YGR017WP53210 297 aa1.65□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W YNR048WP53740 393 aa1.65□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W YDR248CQ03786 193 aa1.65□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W SMP3Q04174 516 aa1.65□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W PEX12Q04370 399 aa1.65□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W GRH1Q04410 372 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W YMR226CQ05016 267 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W GPN3Q06543 272 aa1.65□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W SPC3Q12133 184 aa1.65□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W NSL1Q12143 216 aa1.65□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W DPM1P14020 267 aaKnown RBP1.64□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W SAR1P20606 190 aaKnown RBP1.64□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W MEK1P24719 497 aaPredicted RBP1.64□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W CSM1P25651 190 aa1.64□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W VMA5P31412 392 aaKnown RBP1.64□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W HYM1P32464 399 aa1.64□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W YBL059WP34224 193 aa1.64□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W SRP102P36057 244 aaPredicted RBP1.64□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W MRPL3P36516 390 aa1.64□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W MIX23P38162 196 aa1.64□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W VHS2P40463 436 aa1.64□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W MSS2P40990 351 aa1.64□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W RPA34P47006 233 aaPredicted RBP1.64□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W VPS55P47111 140 aa1.64□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W PMT5P52867 743 aa1.64□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W RRN9P53437 365 aa1.64□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W GPI15P53961 229 aa1.64□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W BCP1Q06338 283 aa1.64□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W YNG1Q08465 219 aa1.64□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W SNX3Q08826 162 aaKnown RBP1.64□□□□□ -2.15
SSQ1YLR369W ATO3Q12359 275 aa1.64□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 7.5 ms