RNA–Protein interactions for RNA: YLR165C

PUS5, Transcript of Pseudouridine synthase, yeast

Gene PUS5, Length 765 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUS5	YLR165C	TVP23	P38962	199 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	YIL001W	P40560	513 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	YDR114C	Q04597	100 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	YLR030W	Q07967	263 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	YPL257W	Q08974	193 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	BBP1	Q12365	385 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	COS8	P38723	381 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	TRM5	P38793	499 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	YEL028W	P39989	153 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	RMR1	P53060	241 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	COS6	P53344	381 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	PDR17	P53844	350 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	YML108W	Q03759	105 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	YPR195C	Q06594	109 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	YPR202W	Q08993	238 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	GPM2	Q12008	311 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	YDL012C	Q12489	107 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	APA2	P22108	325 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	BMT5	P40493	336 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	ERV29	P53337	310 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	RCF2	P53721	224 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	YML096W	Q04489	525 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	OCA6	Q12454	224 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	LAA1	P39526	2014 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	QCR7	P00128	127 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	HAP2	P06774	265 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.69	□□□□□ -1.66	not detected
PUS5	YLR165C	YDR248C	Q03786	193 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	SWC7	Q06707	132 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	YHR139C-A	O13536	103 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	SGA1	P08019	549 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	OAC1	P32332	324 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	AGA2	P32781	87 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	YCR087C-A	P37263	153 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	GON7	P46984	123 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	GTR2	P53290	341 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	YDR476C	Q03362	224 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	CSN9	Q03981	162 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	AGC1	Q12482	902 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	MOT1	P32333	1867 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	ECM29	P38737	1868 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	MET2	P08465	486 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	DSF1	P0CX08	502 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	GCN3	P14741	305 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	MRPS28	P21771	286 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	SPS18	P32572	300 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	OST2	P46964	130 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	GRX8	Q05926	109 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.67	□□□□□ -1.66	not detected
PUS5	YLR165C	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	FAR7	P43592	221 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	TIM13	P53299	105 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	ABF2	Q02486	183 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	YMD8	Q03697	442 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PUS5	YLR165C	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	RSM10	Q03201	203 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	TFC1	P32367	649 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	APS1	P35181	156 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	PTC1	P35182	281 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
PUS5	YLR165C	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	HPM1	P40481	377 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	AIF1	P52923	378 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	SLM2	P53955	656 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	LDB18	Q07887	179 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	YOR268C	Q08734	132 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	FCY2	P17064	533 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	PTM1	P32857	523 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	PIR5	P46999	287 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	DYN3	Q04949	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	SPC2	Q04969	178 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	NMT1	P14743	455 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	ADE1	P27616	306 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	DOG2	P38773	246 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	DOG1	P38774	246 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PUS5	YLR165C	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67

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