RNA–Protein interactions for RNA: YKR071C

DRE2, Transcript of Component of the cytosolic Fe-S protein assembly (CIA) machinery, yeast

Gene DRE2, Length 1,047 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DRE2	YKR071C	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	SWD3	P38123	315 aa		5.12	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	YKE4	P40544	346 aa		5.12	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	RSM27	P53305	110 aa		5.12	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	MRPL13	Q02204	264 aa		5.12	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	VAM7	P32912	316 aa		5.11	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	YKL075C	P36083	450 aa		5.11	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	MBA1	P38300	278 aa		5.11	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	NVJ1	P38881	321 aa		5.11	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	PHM8	P40025	321 aa		5.11	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	MCH1	Q07376	486 aa		5.11	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	YPD1	Q07688	167 aa		5.11	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	YOL118C	Q08259	102 aa		5.11	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	PET18	P25362	215 aa		5.1	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	AHC2	P25649	128 aa		5.1	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	SSO2	P39926	295 aa		5.1	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	GWT1	P47026	490 aa		5.1	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	IRC18	P47056	224 aa		5.1	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	BUD25	P85052	153 aa		5.1	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	CTF19	Q02732	369 aa		5.1	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	USV1	Q12132	391 aa		5.1	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	YOS1	Q3E834	85 aa		5.1	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	OCH1	P31755	480 aa		5.09	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	FLO10	P36170	1169 aa		5.09	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	YJL213W	P40896	331 aa		5.09	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	BXI1	P48558	297 aa		5.09	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	DOC1	P53068	250 aa		5.09	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	TPN1	P53099	579 aa		5.09	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	TOS8	P53147	276 aa		5.09	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	IMO32	P53219	342 aa		5.09	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	MSC3	Q05812	728 aa		5.09	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	PHO92	Q06390	306 aa		5.09	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	AEP3	Q12089	606 aa		5.09	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	SWT1	Q12104	458 aa		5.09	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
DRE2	YKR071C	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		5.08	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	AUA1	P32450	94 aa		5.08	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.08	□□□□□ -1.6	not detected
DRE2	YKR071C	YGR210C	P42942	411 aa		5.08	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	YJL118W	P47022	219 aa		5.08	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	MRPL35	Q06678	367 aa		5.08	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	NDE2	Q07500	545 aa		5.08	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	GCN4	P03069	281 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	CAB4	P53332	305 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	LPP1	Q04396	274 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	PRM3	Q08931	133 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	DGK1	Q12382	290 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	POM34	Q12445	299 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	SUS1	Q6WNK7	96 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		5.07	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	MDM10	P18409	493 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	LSB5	P25369	354 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	AGA2	P32781	87 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	PCL7	P40186	285 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	SOL1	P50278	321 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	ERV29	P53337	310 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	MRPS16	Q02608	121 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	YLR281C	Q05863	155 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	GEP3	Q08622	556 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	YPL199C	Q08954	240 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	PET54	P10834	293 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	RNP1	P32385	249 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	UTR5	P32630	166 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	YBR137W	P38276	179 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	YBR242W	P38331	238 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	IKI1	P38874	309 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	FMP48	P53233	369 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	MRPL50	P53724	139 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	YHP1	Q04116	353 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	TSA2	Q04120	196 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	YDR286C	Q05530	114 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	GPN3	Q06543	272 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	FMP16	Q12497	93 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	ODC2	Q99297	307 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	QCR7	P00128	127 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	MRS4	P23500	304 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
DRE2	YKR071C	MRP20	P32387	263 aa		5.04	□□□□□ -1.6

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.6 ms