RNA–Protein interactions for RNA: YHR143W-A

RPC10, Transcript of RNA polymerase subunit ABC10-alpha, found in RNA pol I, II, and III, yeastyeast

Gene RPC10, Length 213 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPC10YHR143W-A YAE1P47118 141 aaPredicted RBP0.91□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A PDR17P53844 350 aa0.91□□□□□ -2.26
RPC10YHR143W-A RPL25P04456 142 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A PBN1P25580 416 aa0.9□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A LSM7P53905 115 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A YDR274CP87283 123 aa0.9□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A RCE1Q03530 315 aa0.9□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A RAD28Q12021 506 aa0.9□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A STE18P18852 110 aa0.89□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A ATP15P21306 62 aa0.89□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A KDX1P36005 433 aa0.89□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A EDC3P39998 551 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A FLX1P40464 311 aa0.89□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A ARO8P53090 500 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A COG5P53951 403 aa0.89□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A YMR007WQ03675 126 aa0.89□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A YHR007C-AQ07074 71 aa0.89□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A YHR214C-EQ8TGK0 99 aa0.89□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A YFR032C-BQ8TGU2 87 aa0.89□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A YIL177CP40434 1758 aa0.88□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A YJL225CP40889 1758 aa0.88□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A RPL27AP0C2H6 136 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A COQ1P18900 473 aa0.88□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A CKS1P20486 150 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A PRP18P33411 251 aaPredicted RBP0.88□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A VMA22P38784 181 aa0.88□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A TRM5P38793 499 aa0.88□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A HMF1P40037 129 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A YNL194CP40169 301 aa0.88□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A YNL247WP53852 767 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A CWC27Q02770 301 aa0.88□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A YNG1Q08465 219 aa0.88□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A MDM32Q12171 622 aa0.88□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A AQY2P0CD90 149 aa0.87□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A CBT1P36038 271 aaPredicted RBP0.87□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A ECM4P36156 370 aa0.87□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A YEL067CP39978 195 aa0.87□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A MSS2P40990 351 aa0.87□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A GCN20P43535 752 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A CWC23P52868 283 aaPredicted RBP0.87□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A PET191Q02772 108 aa0.87□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A ODC2Q99297 307 aa0.87□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A MDM35O60200 86 aa0.86□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A CDC33P07260 213 aaKnown RBP0.86□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A MER1P16523 270 aa0.86□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A OCH1P31755 480 aa0.86□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A YHL042WP38729 150 aa0.86□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A SOK1P40317 901 aa0.86□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A RAD17P48581 401 aa0.86□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A HNT1Q04344 158 aaKnown RBP0.86□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A RUD3Q12234 484 aaKnown RBP0.86□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A YDR157WA0A023PZE8 133 aa0.85□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A SPO13P23624 291 aa0.85□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A SPS18P32572 300 aa0.85□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A YCR087C-AP37263 153 aa0.85□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A HYR1P40581 163 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A YFL065CP43539 102 aa0.85□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A RPL37AP49166 88 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A MPC3P53311 146 aa0.85□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP0.85□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A YCR090CP25654 182 aaKnown RBP0.84□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A PAN3P36102 679 aaPredicted RBP0.84□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A YOL160WQ08321 113 aa0.84□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A DGA1Q08650 418 aa0.84□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A YRA1Q12159 226 aaKnown RBP0.84□□□□□ -2.27
RPC10YHR143W-A CYR1P08678 2026 aaKnown RBP0.83□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A NSP1P14907 823 aaKnown RBP0.83□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A YPK2P18961 677 aa0.83□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A IKI1P38874 309 aa0.83□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A TVP23P38962 199 aa0.83□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A YPL073CP40323 161 aa0.83□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A ERG10P41338 398 aaKnown RBP0.83□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A GET1P53192 235 aa0.83□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A BNA7Q04066 261 aa0.83□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A DYN3Q04949 312 aa0.83□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A POR1P04840 283 aaKnown RBP0.82□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A YHR212W-AP0CX91 67 aa0.82□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A TAF14P35189 244 aa0.82□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A YFH7P43591 353 aa0.82□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A SKI6P46948 246 aaPredicted RBP0.82□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A AIM25P47140 327 aa0.82□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A PGA2P53903 129 aa0.82□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A DAD4P69851 72 aa0.82□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A FUS2Q05670 677 aa0.82□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A GGA1Q06336 557 aa0.82□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A CDC36P06100 191 aaPredicted RBP0.81□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A CNB1P25296 175 aa0.81□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A AIM2P39721 246 aa0.81□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A HPA3P39979 161 aa0.81□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A YEA4P40004 342 aa0.81□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A YER134CP40081 178 aa0.81□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A HUA1P40325 198 aa0.81□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A UBC12P52491 188 aa0.81□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A YMR252CQ04814 134 aa0.81□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A YER188C-AP0C0V2 99 aa0.8□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A PHO85P17157 305 aa0.8□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A RFA3P26755 122 aaKnown RBP0.8□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A YHL018WP38744 120 aaPredicted RBP0.8□□□□□ -2.28
RPC10YHR143W-A SER2P42941 309 aa0.8□□□□□ -2.28
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