RNA–Protein interactions for RNA: YHR064C

SSZ1, Transcript of Hsp70 protein that interacts with Zuo1p (a DnaJ homolog), yeast

Gene SSZ1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSZ1	YHR064C	RTS2	P40962	232 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	OST3	P48439	350 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	YNR061C	P53747	219 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	SEN15	Q04675	128 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	YDR286C	Q05530	114 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	DIC1	Q06143	298 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	PIN3	Q06449	215 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	GRE1	Q08969	168 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	ATG5	Q12380	294 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	ERV1	P27882	189 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	AHT1	P29589	182 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	DAL3	P32459	195 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	MNS1	P32906	549 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	PTC7	P38797	343 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	PFS1	P38872	237 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	CTK2	P46962	323 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	YAP1802	P53309	568 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	YNR048W	P53740	393 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	SWS2	P53937	143 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	APS2	Q00381	147 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	RSM23	Q01163	450 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	GIS1	Q03833	894 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	CTS2	Q06350	511 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	YPL264C	Q08980	353 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	ERV2	Q12284	196 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	HMS1	Q12398	434 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	YPR117W	Q06116	2489 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	RIP1	P08067	215 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	MRS4	P23500	304 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	MXR2	P25566	168 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	IMG1	P25626	169 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	OCH1	P31755	480 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	YUH1	P35127	236 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	YKL075C	P36083	450 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	ALG14	P38242	237 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	PRM5	P40476	318 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	YGR149W	P48236	432 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	TNA1	P53322	534 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	PDR17	P53844	350 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	SAE3	P89114	91 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	YFT2	Q06676	274 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	QCR9	P22289	66 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	HSP150	P32478	413 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	EMP70	P32802	667 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	REC114	P32841	428 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	RPB7	P34087	171 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	SEF1	P34228	1148 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	PAC2	P39937	518 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	PIG2	P40187	538 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	SPG5	P42933	373 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	YGR126W	P53274	230 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	YNR014W	P53719	212 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	COQ11	Q05892	277 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	LAS17	Q12446	633 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	BET2	P20133	325 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	ATG15	P25641	520 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	COQ3	P27680	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	YKL097C	P34245	136 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	FIG1	P38224	298 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	WSC4	P38739	605 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	YND1	P40009	630 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	GLC8	P41818	229 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	YPL039W	Q03080	316 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	POM33	Q12164	279 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	HUT1	Q12520	339 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	COX5B	P00425	151 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	SPO13	P23624	291 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	VMA16	P23968	213 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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