RNA–Protein interactions for RNA: YHR039C

MSC7, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene MSC7, Length 1,935 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSC7	YHR039C	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
MSC7	YHR039C	TRS20	P38334	175 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MSC7	YHR039C	DLS1	P40366	167 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MSC7	YHR039C	EGT2	P42835	1041 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MSC7	YHR039C	MCM22	P47167	239 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MSC7	YHR039C	YGR219W	P53307	113 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MSC7	YHR039C	WSC2	P53832	503 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MSC7	YHR039C	PDR17	P53844	350 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MSC7	YHR039C	YNL095C	P53932	642 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MSC7	YHR039C	MSS11	Q03825	758 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MSC7	YHR039C	YMR087W	Q04299	284 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MSC7	YHR039C	VBA1	Q04301	562 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MSC7	YHR039C	SCW10	Q04951	389 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MSC7	YHR039C	SWC7	Q06707	132 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MSC7	YHR039C	BOL1	Q3E793	110 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MSC7	YHR039C	KTI11	Q3E840	82 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MSC7	YHR039C	IGO2	Q9P305	131 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MSC7	YHR039C	BI2	P03873	423 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	YIL024C	P40543	189 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	SAS2	P40963	338 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	SNO3	P43544	222 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	ERG25	P53045	309 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	SNO2	P53823	222 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.21	□□□□□ -1.74	not detected
MSC7	YHR039C	NAT3	Q06504	195 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	YOR376W	Q08900	122 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	MCT1	Q12283	360 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	YPR015C	Q12531	247 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	PAI3	P01094	68 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	MRS1	P07266	363 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	CAP2	P13517	287 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	MBR1	P23493	339 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	MSN2	P33748	704 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	YHK8	P38776	514 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	GON7	P46984	123 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	TIS11	P47977	285 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	INP1	Q03694	420 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	YLR042C	Q07990	161 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	THI20	Q08224	551 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	ERS1	P17261	260 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	MRPS5	P33759	307 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	YIL059C	P40520	121 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	APQ12	P40532	138 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	MOB2	P43563	287 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	HXT10	P43581	546 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	YGR039W	P53225	103 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	CDC14	Q00684	551 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	BSP1	Q06604	576 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	MSW1	P04803	379 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	RAD6	P06104	172 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	MTC7	P32633	139 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	SWM2	P40342	146 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	SFT1	P43682	97 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	GCV1	P48015	400 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	SDT1	P53078	280 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	RSM10	Q03201	203 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	RCE1	Q03530	315 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	UPS1	Q05776	175 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	CSI2	Q08054	341 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	YNL277W-A	Q3E7Z0	62 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	COX10	P21592	462 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	MXR2	P25566	168 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	ATG15	P25641	520 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	YBR144C	P34215	104 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	NDT80	P38830	627 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	GET2	P40056	285 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	HMS2	P47175	358 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	CPD1	P53314	239 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	YLR224W	Q05947	369 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	YOL131W	Q08270	108 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	ACM1	Q08981	209 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	YLR049C	Q12110	428 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	ERV2	Q12284	196 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	HUT1	Q12520	339 aa		4.19	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	HMRA1	P0CY11	126 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	INO4	P13902	151 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	VAC17	P25591	423 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	ECM15	P35195	104 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	INM1	P38710	295 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	MDM31	P38880	579 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	TEM1	P38987	245 aa		4.18	□□□□□ -1.74
MSC7	YHR039C	YPL073C	P40323	161 aa		4.18	□□□□□ -1.74

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