RNA–Protein interactions for RNA: YHL029C

OCA5, Transcript of Cytoplasmic protein required for replication of Brome mosaic virus, yeast

Gene OCA5, Length 2,040 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
OCA5	YHL029C	PRM3	Q08931	133 aa		4.6	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	YPL162C	Q12042	273 aa		4.6	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	MCT1	Q12283	360 aa		4.6	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	CWP1	P28319	239 aa		4.59	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	DCG1	P32460	244 aa		4.59	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	TKL2	P33315	681 aa		4.59	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	SLC1	P33333	303 aa		4.59	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	YKL071W	P36086	256 aa		4.59	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	MRPL16	P38064	232 aa		4.59	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	SLM6	P38343	150 aa		4.59	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	YIR007W	P40566	764 aa		4.59	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	PAM16	P42949	149 aa		4.59	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	TIM10	P87108	93 aa		4.59	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	MRPL1	Q04599	285 aa		4.59	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	ELP6	Q04868	273 aa		4.59	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	RSF1	Q05043	376 aa		4.59	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	YPR098C	Q06089	161 aa		4.59	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	RRT7	Q07829	113 aa		4.59	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	PFA4	Q12006	378 aa		4.59	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	POM34	Q12445	299 aa		4.59	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		4.59	□□□□□ -1.67
OCA5	YHL029C	ECM29	P38737	1868 aa		4.59	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	RAD6	P06104	172 aa		4.58	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	POX1	P13711	748 aa		4.58	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	COX10	P21592	462 aa		4.58	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	GPI12	P23797	304 aa		4.58	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	THI2	P38141	450 aa		4.58	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	YNL198C	P40166	100 aa		4.58	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	MEP2	P41948	499 aa		4.58	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	LYS5	P50113	272 aa		4.58	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	SCS3	P53012	380 aa		4.58	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	MTM1	P53320	366 aa		4.58	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	DUG3	P53871	357 aa		4.58	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	YOS1	Q3E834	85 aa		4.58	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	FLO1	P32768	1537 aa		4.58	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	COX9	P07255	59 aa		4.58	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	YEA4	P40004	342 aa		4.58	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	HIT1	P46973	164 aa		4.58	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	SFH5	P47008	294 aa		4.58	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	COQ5	P49017	307 aa		4.58	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	HLR1	Q04429	423 aa		4.58	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	COQ11	Q05892	277 aa		4.58	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	PAM18	Q07914	168 aa		4.58	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.57	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	PRO1	P32264	428 aa		4.57	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	YFL065C	P43539	102 aa		4.57	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	AIM34	Q03673	198 aa		4.57	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	YMR252C	Q04814	134 aa		4.57	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	YPR203W	Q08994	102 aa		4.57	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		4.57	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	YOR338W	Q99326	363 aa		4.57	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	SOD2	P00447	233 aa		4.56	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	CUP2	P15315	225 aa		4.56	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	MAK32	P23060	363 aa		4.56	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	PPZ2	P33329	710 aa		4.56	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	TIR2	P33890	251 aa		4.56	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	YBR090C	P38253	122 aa		4.56	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	YGL230C	P53074	147 aa		4.56	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	YNL165W	P53891	406 aa		4.56	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	YML053C	Q04978	212 aa		4.56	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	HXT4	P32467	576 aa		4.56	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	REG2	P38232	338 aa		4.56	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	ATX1	P38636	73 aa		4.56	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	HAC1	P41546	238 aa		4.56	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	YJR096W	P47137	282 aa		4.56	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	UBP8	P50102	471 aa		4.56	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	SNO4	Q04902	237 aa		4.56	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	LIP2	Q06005	328 aa		4.56	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	LDS2	Q08218	356 aa		4.56	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	HSP32	Q08992	237 aa		4.56	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	YOR015W	Q12169	119 aa		4.56	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	CHO1	P08456	276 aa		4.55	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	SCO1	P23833	295 aa		4.55	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	YAL037W	P39728	267 aa		4.55	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	YEL028W	P39989	153 aa		4.55	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	MAF1	P41910	395 aa		4.55	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	YFL054C	P43549	646 aa		4.55	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	YDL186W	P48568	277 aa		4.55	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	PAU4	P53427	120 aa		4.55	□□□□□ -1.68
OCA5	YHL029C	ARR3	Q06598	404 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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