RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeastyeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSA4YER103W PIC2P40035 300 aa11.12□□□□□ -0.63
SSA4YER103W RPN14P53196 417 aa11.12□□□□□ -0.63
SSA4YER103W MIM1Q08176 113 aa11.12□□□□□ -0.63
SSA4YER103W DAD2P36162 133 aa11.11□□□□□ -0.63
SSA4YER103W MIX23P38162 196 aa11.11□□□□□ -0.63
SSA4YER103W POP2P39008 433 aa11.11□□□□□ -0.63
SSA4YER103W YFR054CP43622 192 aa11.11□□□□□ -0.63
SSA4YER103W TTI2P47168 421 aa11.11□□□□□ -0.63
SSA4YER103W YLR179CQ06252 201 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
SSA4YER103W FRE7Q12333 620 aa11.11□□□□□ -0.63
SSA4YER103W MSW1P04803 379 aa11.11□□□□□ -0.63
SSA4YER103W YPR071WQ12346 211 aa11.11□□□□□ -0.63
SSA4YER103W YKL102CP34249 101 aa11.09□□□□□ -0.63
SSA4YER103W RPB11P38902 120 aa11.09□□□□□ -0.63
SSA4YER103W CIN5P40917 295 aa11.09□□□□□ -0.63
SSA4YER103W ZIM17P42844 174 aa11.09□□□□□ -0.63
SSA4YER103W DAL4Q04895 635 aa11.09□□□□□ -0.63
SSA4YER103W CTS2Q06350 511 aa11.09□□□□□ -0.63
SSA4YER103W YFT2Q06676 274 aa11.09□□□□□ -0.63
SSA4YER103W MCH4Q08268 501 aa11.09□□□□□ -0.63
SSA4YER103W YLR365WQ7LIF2 110 aa11.09□□□□□ -0.63
SSA4YER103W ERV1P27882 189 aa11.09□□□□□ -0.63
SSA4YER103W UTR5P32630 166 aa11.09□□□□□ -0.63
SSA4YER103W DOG1P38774 246 aa11.09□□□□□ -0.63
SSA4YER103W TPT1Q12272 230 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
SSA4YER103W COX2P00410 251 aa11.08□□□□□ -0.64
SSA4YER103W OSW5P40219 148 aa11.08□□□□□ -0.64
SSA4YER103W PDR17P53844 350 aa11.08□□□□□ -0.64
SSA4YER103W IZH3Q07959 543 aa11.08□□□□□ -0.64
SSA4YER103W DAT1P13483 248 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
SSA4YER103W SHB17P36136 271 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
SSA4YER103W ALG14P38242 237 aa11.07□□□□□ -0.64
SSA4YER103W LOC1P43586 204 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
SSA4YER103W YPL039WQ03080 316 aa11.07□□□□□ -0.64
SSA4YER103W COQ11Q05892 277 aa11.07□□□□□ -0.64
SSA4YER103W NAT3Q06504 195 aa11.07□□□□□ -0.64
SSA4YER103W YPL264CQ08980 353 aa11.07□□□□□ -0.64
SSA4YER103W YKL187CP34231 750 aa11.07□□□□□ -0.64
SSA4YER103W PAU16P35994 123 aa11.07□□□□□ -0.64
SSA4YER103W LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data11.07□□□□□ -0.64not detected
SSA4YER103W SNO3P43544 222 aa11.07□□□□□ -0.64
SSA4YER103W YNR014WP53719 212 aa11.07□□□□□ -0.64
SSA4YER103W HED1Q03937 162 aa11.07□□□□□ -0.64
SSA4YER103W TSA2Q04120 196 aa11.07□□□□□ -0.64
SSA4YER103W OCH1P31755 480 aa11.06□□□□□ -0.64
SSA4YER103W PAC2P39937 518 aa11.06□□□□□ -0.64
SSA4YER103W MID1P41821 548 aa11.06□□□□□ -0.64
SSA4YER103W HSV2P50079 448 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
SSA4YER103W UPS3Q04006 179 aa11.06□□□□□ -0.64
SSA4YER103W YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
SSA4YER103W YDL157CQ12082 118 aa11.06□□□□□ -0.64
SSA4YER103W SPS18P32572 300 aa11.05□□□□□ -0.64
SSA4YER103W AME1P38313 324 aa11.05□□□□□ -0.64
SSA4YER103W WSC4P38739 605 aa11.05□□□□□ -0.64
SSA4YER103W PEX21P50091 288 aa11.05□□□□□ -0.64
SSA4YER103W LEE1Q02799 301 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
SSA4YER103W YOL024WQ08172 172 aa11.05□□□□□ -0.64
SSA4YER103W YER134CP40081 178 aa11.05□□□□□ -0.64
SSA4YER103W THG1P53215 237 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
SSA4YER103W RPL21AQ02753 160 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
SSA4YER103W IZH1Q03419 316 aa11.05□□□□□ -0.64
SSA4YER103W HRI1Q05905 244 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
SSA4YER103W IRC19Q07843 230 aa11.05□□□□□ -0.64
SSA4YER103W TGS1Q12052 315 aa11.05□□□□□ -0.64
SSA4YER103W RPL21BQ12672 160 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
SSA4YER103W HUG1Q6Q5K6 68 aa11.05□□□□□ -0.64
SSA4YER103W NAG1Q8TGN9 163 aa11.05□□□□□ -0.64
SSA4YER103W YPR170W-BP0C5R9 85 aa11.04□□□□□ -0.64
SSA4YER103W FPR1P20081 114 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
SSA4YER103W PCL1P24867 279 aa11.04□□□□□ -0.64
SSA4YER103W MED6P38782 295 aa11.04□□□□□ -0.64
SSA4YER103W DUG3P53871 357 aa11.04□□□□□ -0.64
SSA4YER103W YDR286CQ05530 114 aa11.04□□□□□ -0.64
SSA4YER103W FRE8Q12209 686 aa11.04□□□□□ -0.64
SSA4YER103W HUT1Q12520 339 aa11.04□□□□□ -0.64
SSA4YER103W QCR9P22289 66 aa11.03□□□□□ -0.64
SSA4YER103W ATF1P40353 525 aa11.03□□□□□ -0.64
SSA4YER103W YPL077CQ02831 240 aa11.03□□□□□ -0.64
SSA4YER103W OPI10Q08202 246 aa11.03□□□□□ -0.64
SSA4YER103W IRC13Q08630 104 aa11.03□□□□□ -0.64
SSA4YER103W YPR108W-AQ3E7B3 70 aa11.03□□□□□ -0.64
SSA4YER103W MES1P00958 751 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
SSA4YER103W RPS22AP0C0W1 130 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
SSA4YER103W AIM17P23180 465 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
SSA4YER103W SUA7P29055 345 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
SSA4YER103W GPI2P46961 280 aa11.03□□□□□ -0.64
SSA4YER103W YNR040WP53736 256 aa11.03□□□□□ -0.64
SSA4YER103W YOL029CQ08187 201 aa11.03□□□□□ -0.64
SSA4YER103W CWP1P28319 239 aa11.02□□□□□ -0.65
SSA4YER103W PEX4P29340 183 aa11.02□□□□□ -0.65
SSA4YER103W PMU1P36069 295 aa11.02□□□□□ -0.65
SSA4YER103W ELO1P39540 310 aa11.02□□□□□ -0.65
SSA4YER103W YND1P40009 630 aa11.02□□□□□ -0.65
SSA4YER103W YPR147CQ06522 304 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
SSA4YER103W PAM18Q07914 168 aa11.02□□□□□ -0.65
SSA4YER103W DDI2P0CH63 225 aa11.01□□□□□ -0.65
SSA4YER103W DDI3P0CH64 225 aa11.01□□□□□ -0.65
SSA4YER103W RPB7P34087 171 aa11.01□□□□□ -0.65
SSA4YER103W YGR269WP40326 108 aa11.01□□□□□ -0.65
SSA4YER103W YIL169CP40442 995 aa11.01□□□□□ -0.65
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