RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638664.1

SPIN3-210, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,793 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-210ENST00000638664 NUMBLQ9Y6R0 609 aa14.6□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 TCP10L2B9ZVM9 353 aa14.6□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 NFIBO00712 420 aa14.6□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 MAGEB2O15479 319 aa14.6□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 EDF1O60869 148 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 LINGO3P0C6S8 592 aa14.6□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 NPTX2P47972 431 aa14.6□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 NOP14P78316 857 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 PODNQ7Z5L7 613 aa14.6□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 RHOT1Q8IXI2 618 aa14.6□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 BBOF1Q8ND07 529 aa14.6□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa14.6□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 NPHS2Q9NP85 383 aa14.6□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 LRRC37AA6NMS7 1700 aa14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 MYBL1P10243 752 aa14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 PCK1P35558 622 aa14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 ARSEP51690 589 aa14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 NCKAP1LP55160 1127 aa14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 CYP24A1Q07973 514 aa14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 GPS1Q13098 491 aa14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 PDK4Q16654 411 aa14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 ANKMY2Q8IV38 441 aa14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 ZBED8Q8IZ13 594 aa14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 ARMC2Q8NEN0 867 aa14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 TMEM174Q8WUU8 243 aa14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 C10orf82Q8WW14 230 aa14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 BSNDQ8WZ55 320 aa14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 FAM213AQ9BRX8 229 aa14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 DCTN4Q9UJW0 460 aa14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 TMX2Q9Y320 296 aa14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 CLGNO14967 610 aa14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 ALDH3A1P30838 453 aa14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 OVGP1Q12889 678 aa14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 HHATQ5VTY9 493 aa14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 OTOAQ7RTW8 1153 aa14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 RELL1Q8IUW5 271 aa14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 UBN1Q9NPG3 1134 aa14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 HOMER2Q9NSB8 354 aa14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 DCTN3O75935 186 aa14.58□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 ATP5HO75947 161 aa14.58□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 ABHD2P08910 425 aa14.58□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 SESN3P58005 492 aa14.58□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 TRAF1Q13077 416 aa14.58□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 TKFCQ3LXA3 575 aa14.58□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 ANO7Q6IWH7 933 aa14.58□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 LVRNQ6Q4G3 990 aa14.58□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 MON1BQ7L1V2 547 aa14.58□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 CHURC1Q8WUH1 139 aa14.58□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 ZNF516Q92618 1163 aa14.58□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 C1orf112Q9NSG2 853 aa14.58□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 ZFATQ9P243 1243 aa14.58□□□□□ -0.07
SPIN3-210ENST00000638664 CLRN2A0PK11 232 aa14.58□□□□□ -0.08
SPIN3-210ENST00000638664 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
SPIN3-210ENST00000638664 ECE2O60344 883 aa14.58□□□□□ -0.08
SPIN3-210ENST00000638664 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SPIN3-210ENST00000638664 POTEJP0CG39 1038 aa14.58□□□□□ -0.08
SPIN3-210ENST00000638664 PSMC4P43686 418 aa14.58□□□□□ -0.08
SPIN3-210ENST00000638664 TUBP50607 506 aa14.58□□□□□ -0.08
SPIN3-210ENST00000638664 MAMLD1Q13495 774 aa14.58□□□□□ -0.08
SPIN3-210ENST00000638664 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa14.58□□□□□ -0.08
SPIN3-210ENST00000638664 RFWD3Q6PCD5 774 aa14.58□□□□□ -0.08
SPIN3-210ENST00000638664 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
SPIN3-210ENST00000638664 CCDC125Q86Z20 511 aa14.58□□□□□ -0.08
SPIN3-210ENST00000638664 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SPIN3-210ENST00000638664 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SPIN3-210ENST00000638664 IWS1Q96ST2 819 aa14.58□□□□□ -0.08
SPIN3-210ENST00000638664 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SPIN3-210ENST00000638664 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SPIN3-210ENST00000638664 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa14.58□□□□□ -0.08
SPIN3-210ENST00000638664 KMT5AQ9NQR1 393 aa14.58□□□□□ -0.08
SPIN3-210ENST00000638664 CCPG1Q9ULG6 757 aa14.58□□□□□ -0.08
SPIN3-210ENST00000638664 EXOC7Q9UPT5 735 aa14.58□□□□□ -0.08
SPIN3-210ENST00000638664 LRRC42Q9Y546 428 aa14.58□□□□□ -0.08
SPIN3-210ENST00000638664 DPPA5A6NC42 116 aa14.57□□□□□ -0.08
SPIN3-210ENST00000638664 A6NHS1 94 aa14.57□□□□□ -0.08
SPIN3-210ENST00000638664 GOLGA8RI6L899 631 aa14.57□□□□□ -0.08
SPIN3-210ENST00000638664 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SPIN3-210ENST00000638664 PSTPIP1O43586 416 aa14.57□□□□□ -0.08
SPIN3-210ENST00000638664 LIASO43766 372 aa14.57□□□□□ -0.08
SPIN3-210ENST00000638664 ATP9AO75110 1047 aa14.57□□□□□ -0.08
SPIN3-210ENST00000638664 IFNB1P01574 187 aa14.57□□□□□ -0.08
SPIN3-210ENST00000638664 KRT4P19013 534 aa14.57□□□□□ -0.08
SPIN3-210ENST00000638664 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SPIN3-210ENST00000638664 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SPIN3-210ENST00000638664 GAD2Q05329 585 aa14.57□□□□□ -0.08
SPIN3-210ENST00000638664 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SPIN3-210ENST00000638664 MAPK6Q16659 721 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms